發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：安徽
-
2024-12-16 TBtools 批量提取啟動(dòng)子
問(wèn)題：由于基因組文件路徑含有中文報(bào)錯(cuò)？OK，換成英文就沒(méi)用問(wèn)題了。
-
2023-05-23 prefetch 下載報(bào)錯(cuò)
prefetch.3.0.2: Current preference is set to retrieve SRA Normalized For...
-
2023-04-20
廣告太多，
-
2023-04-16 STAR比對(duì)軟件
1、轉(zhuǎn)錄在數(shù)據(jù)比對(duì)軟件STAR是ENCODE計(jì)劃(ENCyclopedia Of DNA Elements,人類基因組DNA元件百科全書計(jì)劃)的...
-
2023-04-14 GFF與GTF的相互轉(zhuǎn)換現(xiàn)在主流的基因組注釋文件GFF3，分為9列，并用制表符分隔。1、序列名（seqname）。一般是染色I(xiàn)D，chr12、來(lái)源（source）。一般...
-
2023-04-11 轉(zhuǎn)錄組原始數(shù)據(jù)下載
1、數(shù)據(jù)獲取 轉(zhuǎn)錄組原始數(shù)據(jù)一般以SRA的格式存放于NCBI，并且有一個(gè)ID，如一個(gè)項(xiàng)目ID：PRJNA778905；單個(gè)原始數(shù)據(jù)的ID：SRP...
-
基因家族共線性分析之一1、準(zhǔn)備序列和GFF文件 過(guò)濾gff3文件awk '1}' | awk '{print 9"\t"5}' | sed 's/ID=//' > ...
-
2023-04-08 基因家族共性性分析
隨計(jì) 1、利用Pfam 查找基因家族 2、準(zhǔn)備大蒜、洋蔥、大蔥的蛋白序列、CDS序列、基因組序列、GFF3文件 3、使用blast+比對(duì)或者di...
-
SnpEff 注釋SNP/Indel
SnpEff 軟件需要使用Java運(yùn)行，常用的兩個(gè)命令build和eff, build 用于構(gòu)建數(shù)據(jù)庫(kù)，eff用于對(duì)SNP/Indel 進(jìn)行注釋...