最近新發(fā)現(xiàn)一個工具——parallel-fastq-dump，能多線程運行fastq-dump處理SRA文件，而且與另一個常用的多線程工具fasterq-dump相比，還有-...
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fastq-dump、fasterq-dump和parallel-fastq-dump處理SRA文件的速度比較 -
隨筆 | 推薦了解 | 一款持續(xù)更新了30多年的基因預(yù)測軟件 - GeneMark
最近做基因組數(shù)據(jù)分析多一些，這個是自然，現(xiàn)在可能三五萬就可以輕松搞定一個常規(guī)基因組（1G以下二倍體），后續(xù)可以分析，或者需要分析的內(nèi)容有很多，可以挖掘的故事也很多。自然而然也...
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全基因組復(fù)制 WGD |（一）簡介
01 什么是全基因組復(fù)制 多倍化（polyploidy）或全基因加倍/復(fù)制（whole genome duplication, WGD）事件是指基因組內(nèi)的所有序列都發(fā)生重復(fù)，...
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基因組文章 | 粉葛 《Horticulture Research》 2022
粉葛基因組及多組學(xué)分析為其重要次生代謝產(chǎn)物的生物合成研究提供了新見解 2022年1月19日，廣西農(nóng)科院經(jīng)濟(jì)作物所嚴(yán)華兵團(tuán)隊聯(lián)合菲沙基因在園藝領(lǐng)域權(quán)威期刊Horticultur...
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InterProScan 最強(qiáng)基因功能注釋軟件 - 最簡流程代碼參考官方文檔，目前 Interproscan 本地版幾乎免安裝，自帶數(shù)據(jù)庫，使用簡單。 下載與安裝 跳轉(zhuǎn)到軟件放置目錄 注意到軟件依賴 Java11 或者以上 使用軟件 蛋白...
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聽說你服務(wù)器上無法訪問github？或者很慢？
這兩天正好在配置新環(huán)境，發(fā)現(xiàn)校園網(wǎng)絡(luò)似乎有時候無法訪問github，或者即使能訪問速度也很慢...簡單檢索，發(fā)現(xiàn)原來有很多解決辦法： 掛代理，比如自己本地電腦做代理，反向 S...
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Linux那點事-xargs命令詳解Linux xargs 命令 xargs原理剖析及用法詳解 1. 為什么需要xargs命令 1.1 管道|的缺陷 管道實現(xiàn)的是將前面的輸出stdout作為后面的輸入stdin...
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基因組- genome survey（1）尚未進(jìn)行基因組測序的物種，在進(jìn)行基因組測序前，首先需對該物種進(jìn)行 genome survey。一般通過兩個途徑：細(xì)胞遺傳學(xué)（這里只講流式細(xì)胞術(shù)）和基因組測序 1、基因組大小定...
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【名詞解釋】synteny / collinearity / identity / similarity / homology1. synteny 和 collinearity 用來描述基因組的共線性 synteny 共線性：同源基因在相應(yīng)染色體上的保留collinearity 同線性：在synte...
個人介紹
上百個動植物基因組組裝（華中農(nóng)已畢業(yè)的生物狗）的分析小經(jīng)驗~不定時記錄日常搬磚踩坑記錄~
學(xué)無止境，溫故而知新~說清楚問題，有問有回，禮貌的人才能得到回復(fù)
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