寫(xiě)在前面 今天課題組師妹與我提到，其要下載Phytozome上的所有數(shù)據(jù)。這個(gè)事情，我在早在幾年前干過(guò)。不過(guò)前年有整了一次。整體簡(jiǎn)單，以下附上之前的記錄。 2017年的記錄 ...
IP屬地：貴州
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批量下載JGI（phytozome植物基因組數(shù)據(jù)庫(kù)）數(shù)據(jù) -
構(gòu)建自己物種的orgDb
1.首先安裝eggnog-mapper軟件 注釋所需要的物種數(shù)據(jù)庫(kù)網(wǎng)址如下，同時(shí)也可以用里面的腳本download_eggnog_data.py下載你所需要的數(shù)據(jù)庫(kù)： egg...
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根據(jù)自己構(gòu)建的orgDb進(jìn)行GO分析1. 在Rstiduo中安裝自己的orgDb包 2. 載入R包并大致查看一下R包的內(nèi)容 可用keys（）命令查看一下這個(gè)包大致有哪些genes。 可用select（）命令查一...
