發(fā)簡信
IP屬地：四川
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vs code更改默認終端 conda activate激活
緣起：今天想嘗試在vs code中使用python，出現(xiàn)了幾行warning，大意是conda無法激活。 總結(jié)經(jīng)驗： Anaconda可以看作是...
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Rnbeads包差異甲基化分析愚人節(jié)快樂。 導入數(shù)據(jù)，設(shè)置選項 hESCs vshiPSCs 注釋文件路徑 告訴軟件測序數(shù)據(jù)是哪個平臺的數(shù)據(jù) 測序數(shù)據(jù)路徑（450K：idat...
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差異分析的檢驗方法前言 眾所周知，當你所自己今年比去年更優(yōu)秀的時候是不可以隨便吹牛的，請把你在簡書上發(fā)文的頻率以及質(zhì)量擺出來！ 面對今年和去年的數(shù)據(jù)，或許你需要一...
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如何從UCSC上下載注釋文件以及gene_id相互對照文件下載注釋文件（以hg19為例） 下載gene_id相互對照文件 UCSC上的注釋文件還是非常全面的，clade選擇大的分支，genome選擇物種...
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回家了，bug來了[lt@localhost ~]$ java -version Error: dl failure on line 597 Error: fai...
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復盤總結(jié)（五）
今天做展示PPT的時候發(fā)現(xiàn)可以用一種更簡單的方式計算之前計算過的內(nèi)容，因此更新一下之前的結(jié)果。1.相關(guān)性分析結(jié)果 2.組織特異性甲基化的啟動子區(qū)...
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復盤總結(jié)（四）
特異性分析 得到1495個組織特異性的啟動子甲基化區(qū)域。（由12118個啟動子甲基化區(qū)域得到）不重復的基因只有1392個，有一些基因在不只一個組...
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復盤總結(jié)（三）GTEX表達矩陣預處理 R語言學習：1.append添加新的列。2.R語言處理大規(guī)模數(shù)據(jù)速度不算快，通過安裝其他包比如data.table可以提...
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復盤總結(jié)（二）
接復盤總結(jié)（一） methylkit R包上游處理 對甲基化位點進行注釋、導出SPM分析上游文件 幾點說明：1.啟動子區(qū)域的選取：上下游250b...