之前有過用二代測序的數(shù)據(jù)組裝植物葉綠體基因組昆蟲線粒體的經(jīng)歷，用的是單位的超算（Linux系統(tǒng)）。 用到的軟件為Getorganelle和Mitofinder，這里先介紹Ge...
發(fā)簡信
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細(xì)胞器基因組的組裝和注釋（Getorganelle ） -
biomod2介紹與正確安裝
biomod2提供了運(yùn)行多達(dá)10種物種分布模擬模型，以模擬特定物種與其環(huán)境之間的關(guān)系，試圖利用環(huán)境變量（溫度、降水......）來定義一個(gè)特定物種的生態(tài)位。例如，在氣候和土地...
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R包做主成分分析（含實(shí)例）注：內(nèi)容非原創(chuàng)，來自對網(wǎng)站http://www.sthda.com/english/articles/31-principal-component-methods-in-r-...
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七. 植物葉綠體基因組--組裝，注釋和比較作圖（GetOrganelle，GeSeq，Chloroplot，IRscope）一. 簡介 葉綠體是綠色植物，藻類和藍(lán)細(xì)菌進(jìn)行光合作用的場所，光合作用將水和二氧化碳轉(zhuǎn)變?yōu)橛袡C(jī)化合物并放出氧氣。葉綠體所攜帶遺傳物質(zhì)DNA，以原核細(xì)胞的編碼方式轉(zhuǎn)錄合成一些自...
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生信媛公眾號文章目錄
這資源實(shí)在太贊，情不自禁想要分享與大家一同學(xué)習(xí)。我是一個(gè)不喜歡用手機(jī)看公眾號文章的人，但與每一個(gè)生信入門者一樣急切的需要干貨資源得以入門進(jìn)階，這就是一個(gè)學(xué)習(xí)的寶庫。說句實(shí)話，...
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用R做主成分分析（PCA）及基本參數(shù)的選擇原理我們已經(jīng)在前文中討論過了，這次主要是代碼實(shí)戰(zhàn) 1. 定義一個(gè)數(shù)據(jù)集 2. PCA主函數(shù) 3. 選出值最高的兩個(gè)PC 我們在PCA原理部分已經(jīng)講過了，十個(gè)樣本，會(huì)產(chǎn)生10...
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推薦一些常用的Linux命令！作為一位Java后端開發(fā)，怎能不會(huì)點(diǎn)Linux命令？總結(jié)了一套非常實(shí)用的Linux命令（基于CentOS 7.6），希望對大家有所幫助！ [系統(tǒng)服務(wù)管理] [systemct...
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Linux高級篇之日志管理基本介紹 1、日志文件是重要的系統(tǒng)信息文件、其中記錄了很多重要的系統(tǒng)事件。包括用戶的登錄信息、系統(tǒng)的啟動(dòng)信息、系統(tǒng)的安全信息、郵件相關(guān)信息、各種服務(wù)相關(guān)信息等。2、日志對于安...
