今天有位粉絲問(wèn)了我一個(gè)scanpy讀取10X數(shù)據(jù)報(bào)錯(cuò)的問(wèn)題。報(bào)的錯(cuò)是沒(méi)有找到相應(yīng)的文件。 小編用10X官網(wǎng)的數(shù)據(jù)測(cè)試了一下。文件夾結(jié)構(gòu)如下 讀取代碼如下 是可以成功讀到pyt...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：上海
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scanpy讀10X單細(xì)胞數(shù)據(jù)報(bào)錯(cuò) -
【R語(yǔ)言】隨機(jī)森林代碼
隨著chatGPT的火爆，AI也受到了大家的廣泛關(guān)注。機(jī)器學(xué)習(xí)（Machine learning）作為AI的一種，在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域也有著廣泛的應(yīng)用。今天小編就跟大家分享一個(gè)很流...
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【R】繪制差異lncRNA的火山圖最近有位粉絲咨詢小編，如何基于TCGA差異表達(dá)的數(shù)據(jù)，繪制lncRNA的火山圖。自己折騰了半天，沒(méi)有弄出來(lái)。 今天小編就跟大家分享一下，如何單獨(dú)把lncRNA從所有的差異表達(dá)...
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【R】標(biāo)注ROC曲線上最佳cutoff點(diǎn)前面小編跟大家分享過(guò) 今天我們來(lái)聊一下怎么將這個(gè)最優(yōu)的cutoff值對(duì)應(yīng)的點(diǎn)在ROC曲線上面標(biāo)注出來(lái)。廢話不多說(shuō)，直接上代碼 我們可以得到下面的圖
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【科研熱點(diǎn)】雙硫死亡相關(guān)基因集前面小編跟大家分享過(guò)一些科研熱點(diǎn)相關(guān)的基因集 ? m6A甲基化相關(guān)基因集[https://link.zhihu.com/?target=https%3A//mp.weixin...
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KEGG富集分析又不能做了？前面粉絲反饋過(guò)，KEGG富集分析一直報(bào)錯(cuò)，得不到結(jié)果。小編第一時(shí)間跟大家分享了解決辦法。 ? KEGG富集分析一直報(bào)錯(cuò)，粉絲拯救了我！[https://link.zhihu....
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【粉絲問(wèn)題】挑選GO結(jié)果繪圖，沒(méi)有報(bào)錯(cuò)，也沒(méi)有出圖？前面小編給大家介紹過(guò) ? 如何挑選感興趣的GO條目進(jìn)行展示[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.weixin.qq.com/...
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【R語(yǔ)言】KO富集分析前面小編給大家整理匯總了目前生信交流平臺(tái)上發(fā)布過(guò)的所有與GO和KEGG富集分析相關(guān)的微信文章。 ?【推文匯總】GO和KEGG富集分析及可視化[https://link.zhi...
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【科研熱點(diǎn)】免疫檢查點(diǎn)相關(guān)基因前面小編跟大家分享過(guò)一些科研熱點(diǎn)相關(guān)的基因集 ? m6A甲基化相關(guān)基因集[https://link.zhihu.com/?target=https%3A//mp.weixin...
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【科研熱點(diǎn)】氧化應(yīng)激基因前面小編跟大家分享過(guò)一些科研熱點(diǎn)相關(guān)的基因集 ? m6A甲基化相關(guān)基因集[https://link.zhihu.com/?target=https%3A//mp.weixin...
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微生物組學(xué)數(shù)據(jù)分析和可視化工具匯總最近在研究微生物數(shù)據(jù)分析，發(fā)現(xiàn)了一個(gè)很好的資源。包含一些微生物16s的數(shù)據(jù)，微生物數(shù)據(jù)分析的工具以及一些可視化的工具。分享給大家。微生物組學(xué)數(shù)據(jù)分析和可視化工具匯總[http...
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恭賀新禧，用R放個(gè)煙花慶祝一下！相信在大家的童年記憶里面都有放煙花的美好記憶。關(guān)于春節(jié)應(yīng)不應(yīng)該燃放煙花爆竹的爭(zhēng)論一直都存在。有人說(shuō)沒(méi)有煙花的春節(jié)缺少了一份年味，也有人說(shuō)容易引起火災(zāi)。 我們今天不會(huì)爭(zhēng)論這個(gè)，...
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【科研熱點(diǎn)】溶酶體相關(guān)基因溶酶體（lysosome）又稱溶體、溶小體，存在于細(xì)胞（多存在于動(dòng)物細(xì)胞中，植物細(xì)胞內(nèi)不常見(jiàn)）中，屬于細(xì)胞的內(nèi)膜系統(tǒng)，由高基氏復(fù)合體產(chǎn)生，是單層膜的囊狀胞器，內(nèi)部含有數(shù)十種從...
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復(fù)現(xiàn)SCI文章多序列比對(duì)相似性表格（二）—DNA序列相似性前面通過(guò)視頻給大家介紹一下我們要復(fù)現(xiàn)的內(nèi)容 ? 復(fù)現(xiàn)SCI文章多序列比對(duì)相似性表格（一）[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp...
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【科研熱點(diǎn)】趨化因子/受體相關(guān)基因前面給大家陸續(xù)介紹了一些科研熱點(diǎn)相關(guān)的基因 ? m6A甲基化相關(guān)基因集[https://link.zhihu.com/?target=https%3A//mp.weixin....
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【R】getGEO運(yùn)行報(bào)connection buffer錯(cuò)誤
最近在運(yùn)行GEOquery包中的getGEO函數(shù)讀取series_matrix.txt文件的時(shí)候報(bào)了如下錯(cuò)誤。 從報(bào)錯(cuò)的具體信息來(lái)看，應(yīng)該說(shuō)的是鏈接緩存131072不夠大。 ...
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R四種風(fēng)格展示挑選的GO富集結(jié)果GO富集分析相信大家都不陌生，在很多的SCI文章里面都會(huì)看到。相信大家應(yīng)該都見(jiàn)過(guò)像下面這樣的氣泡圖或者柱形圖。 前面小編給大家系統(tǒng)的介紹了 ? R進(jìn)行GO和KEGG富集分析及...
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【R】氣泡圖和柱形圖展示挑選的KEGG通路KEGG富集分析相信大家都并不陌生。前面小編給大家系統(tǒng)的介紹了 ? R進(jìn)行GO和KEGG富集分析及結(jié)果可視化[https://link.zhihu.com/?target=h...
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【R】一條命令搞定相關(guān)性圖前面小編給大家講解過(guò) ?R計(jì)算多個(gè)向量?jī)蓛芍g相關(guān)性[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.weixin.qq.com/s%3...