您好，我是用Hifi reads 比對參考基因組，結果是這樣的，總reads數比我raw data 要多，比對率是百分百，請問怎么算真正比對上的reads數吖，我想的比對率應該是比對上的除以總的，可是現在比對上的比總的還多，7457937 + 0 in total (QC-passed reads + QC-failed reads)
0 + 0 secondary
910767 + 0 supplementary
0 + 0 duplicates
7457937 + 0 mapped (100.00% : N/A)????
測序數據基本信息統(tǒng)計 | reads,coverage,depth00 寫在前面 測序后公司交付數據時，一般會提供質控后的clean data和后續(xù)的基礎分析結果。因為可能需要自己來進行數據的預處理，記得一定要拿回raw data，同時弄清...
您好，請問4.4的那張圖片是哪一篇文獻中的哇
【WGCNA】WGCNA學習（一）其實我一直沒用過WGCNA，因為分析網絡的方法有很多，但是大家好像都更愛用這個。最近幫人分析的幾組數據，他們指名要用WGCNA分析，所以就學習一下。 =======WGCNA...
正文 正文部分，我想盡可能的從原理出發(fā)，講解WGCNA背后的大致邏輯。我盡可能的在這部分不介紹代碼，以免喧賓奪主般的干擾我們對于WGCNA原理的思考。 先簡單給個目錄，WGC...
不知道為啥3個g的文件，比對的時候內存占到了最高330G，哭了
[隨筆]minimap2 節(jié)約內存minimap2 我是用10G 以上基因組 +100G reads 默認參數下一般消耗20-40G 內存；存入文件時消耗80G 后來思考，-I 參數，對于一些大基因組 ...
樓主，我想請問第四步merge的時候，一直報錯Forward and reverse reads not paired. Check that BAM files have the same read names and are sorted.這個，請問您有遇到過嗎
hic分析之分步工作原理參考之前的文章 hic分析之 hic-pro 介紹與安裝 分步工作原理： 先看test文件 再看看opt文件 工作原理介紹： 1.Reads Mapping 將fastq文...
目的：處理fastq文件中的空白序列，第二行和第四行為空白，將空白以及所在序列都刪除。邏輯：以兩行為一個整體，當輸入文件第二行為空白的時候，則將空白和空白的上一行都刪除；若第...
你好，就是我用conda裝了一款軟件后我就找不到conda了
，而且bin文件里面也沒有conda，想請問一下這是什么原因哇？謝謝
conda安裝軟件后怎么確認軟件安裝成功conda的下載和安裝見conda或者見生信技能書推文conda管理生信軟件一文就夠安裝軟件結束后，會出現三個done但是也只能說明軟件安裝正常結束，但是不能說明軟件能正常使...
您好，在第二步y(tǒng)um安裝我沒有權限，請問需要怎么安裝吖
linux服務器中安裝Rstudio-Server教程時間：2020年2月10日前言：下載新買了一臺騰訊云的服務器，近一天時間進行配置成基礎的生信分析的機子，看到在服務器上可以安裝網頁的Rstudio-Server，出于好奇以及...
要一起拼課嗎？我感覺好貴??
【課程筆記】學CJ在騰訊課堂上的基因家族分析1明晰概念 基因是染色體上一段可以發(fā)生轉錄的區(qū)域 基因≠CDS 基因應該包括：CDS 內含子 UTR 啟動子 可轉錄的區(qū)域是多變的 我們做分析的時候常用的是蛋白序列，而蛋白序列...
