Ubuntu22.04 R 安裝monocle3報錯： 先安裝sf和spdep ubuntu系統(tǒng)里安裝這兩個包需要先安裝以下依賴： 參考：https://r-spatial....
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ERROR: dependencies ‘sf’, ‘spdep’ are not available for package ‘monocle3’
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Seurat 多個樣本運行SCTransform后運行RunPCA的問題報錯如下： 查看合并后的seurat object可以看到詳細情況：合并后var.features是空的，所以RunPCA出錯。 解決方法 1：使用SCT assay中的sc...
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VS Code下Jupyter Lab python文件路徑自動補全設置打開設置（Ctrl+,） 搜索jupyter，顯示如下：圖片 1 點擊Edit in settings.json，打開設置文件：圖片 2 在python下添加 "/"和"\\...
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基因表達差異分析的實驗設計（Ⅰ）關鍵詞：基因表達差異分析、Differential Expression Genes、設計矩陣、Design Matrix、比較矩陣、Contrast Matrix 本文參考...
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CITE-seq：同時測細胞表面蛋白和RNA的單細胞測序單細胞測序方法和原理系列： 1. 單細胞轉錄組建庫原理：SMART、TargetAmp和10X genomics[http://www.itdecent.cn/p/6c5d...
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Ubuntu2204 RStudio server網(wǎng)頁登錄顯示'Error: Unauthorized user.'
檢查rstudio的.log文件/var/log/rstudio/rstudio-server/rserver.log 我的問題是： Rstudio官網(wǎng)的介紹中，最小的use...
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從古代婚姻到現(xiàn)代愛情觀：演變與反思
在探討人類情感關系的歷史變遷時，我們不可避免地要觸及封建社會時期以生產(chǎn)和繁衍為主要目的的婚姻制度以及現(xiàn)代社會所倡導的愛情自由觀念。這兩種截然不同的現(xiàn)象揭示了不同時代背景下的愛...
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春河之畔，柳色青青
每年春天，景淮都會來到這條熟悉的河邊，那里的柳樹如詩如畫，每年準時綻放出最鮮嫩的綠意。今年，他的心情格外不同，因為他知道，云箏會在這里與他相約。他們在大學時代相識，那時的云箏...
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春日覺醒：頹廢之心遇見希望之光
春天，這個萬物復蘇的季節(jié)，帶著溫暖的氣息悄然而至。大地抖落了冬日的沉寂，換上了生機勃勃的新裝。然而，在這充滿活力的景象中，有那么一個人，他的內(nèi)心卻像被遺忘的角落，沉浸在頹廢的...
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infercnv Error in .single_tumor_leiden_subclustering(tumor_group = tumor_group, : lazy-load d...
出現(xiàn)錯誤： 可以嘗試重啟R session，重新執(zhí)行命令
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infercnv Error in `ScaleData()`: ! No layer matching pattern 'data' found. Please run NormalizeDa...
原因 我的R運行環(huán)境里，用的是Seurat v5，出現(xiàn)這個問題主要是Infercnv與新的Seurat對象不兼容 解決 在運行infercnv::run()之前，運行代碼：
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infercnv錯誤 Error in FUN(left, right) : non-numeric argument to binary operator
如果在報錯前出現(xiàn)以下兩條INFO信息： 說明基因注釋文件的格式不對。 原因和解決方法 在infercnv_1.18.1及1.19.1的版本中，出現(xiàn)此錯誤的位置是which(g...
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CentOS7和Rstudio server安裝LAPACK library、JAGS、rjags 和 inferCNV
1. 安裝BLAS和LAPACK library 首先非常感謝參考文章(前兩步都是參考這篇文章)inferCNV centos服務器安裝失敗解決 - 簡書 (jianshu....
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inferCNV centos服務器安裝失敗解決
前言 昨天在安裝inferCNV的包時頻繁報錯，嘗試了很多方式最終解決，現(xiàn)將解決方法記錄如下 服務器版本 CentOS Linux release 7.9.2009 (Cor...
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R 數(shù)據(jù)可視化 —— 對角線分割熱圖前言 不是在幫人解決問題，就是在解決問題的路上~~~。 之前所介紹的熱圖，其每個顏色塊都是一個矩形，而今天要介紹的是如何繪制對角線分割熱圖。也就是每個顏色塊矩形被對角線分割為...
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Python 在list(列表）尾部添加另一個列表的元素
在list(a)尾部添加list(b)有兩種常見的方法：append() / extend() 試試這兩種方法的區(qū)別：append()方法相當于把b作為一個元素添加在a的尾部...
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jupyter-lab 設置密碼(password)
jupyter-lab網(wǎng)頁端有token和passwd兩種驗證登錄方式，個人覺得passwd比較安全且方便一些 首先，生成jupyter-lab默認配置文件，在Termina...
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python爬取網(wǎng)頁內(nèi)容寫入文件時報錯：UnicodeEncodeError: 'gbk' codec can't encode character '\xf6'
問題描述 用r = requests.get(url, params)爬取網(wǎng)頁，新建一個文件并保存r.text時報錯 意思是'gbk'編解碼器不能編碼Unicode字符'\x...
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python 對DataFrame某列的部分（某些）元素賦值
首先創(chuàng)建一個DataFrame 來到賦值場景： 需求：需要對 rating 列的[0, 1, 4]行的3個元素賦值為[[5], [5], [4]]， 也就是同時使用位置索引（...