和大家分享一個(gè)近幾年我一直在經(jīng)歷的問(wèn)題“內(nèi)耗型拖延”:總是決定做一件事情之前,愛(ài)磨嘰,然后坐下來(lái),始終沒(méi)開(kāi)始,確已經(jīng)很耗精氣神了。 其實(shí)只需要1分鐘行動(dòng)原則,就可以避免掉很多...
和大家分享一個(gè)近幾年我一直在經(jīng)歷的問(wèn)題“內(nèi)耗型拖延”:總是決定做一件事情之前,愛(ài)磨嘰,然后坐下來(lái),始終沒(méi)開(kāi)始,確已經(jīng)很耗精氣神了。 其實(shí)只需要1分鐘行動(dòng)原則,就可以避免掉很多...
有一些生信寫(xiě)的小代碼,想給實(shí)驗(yàn)的或不熟悉代碼的同事用的話,如果給代碼,還要依賴包,或運(yùn)行環(huán)境,可以打包成一個(gè)exe的程序,有圖形界面方便用戶操作。如下示例將Python腳本打...
GitHub Pages 是一個(gè)免費(fèi)的靜態(tài)網(wǎng)站托管服務(wù),由 GitHub 提供。它允許用戶通過(guò) GitHub 倉(cāng)庫(kù)來(lái)托管個(gè)人、項(xiàng)目或組織的網(wǎng)頁(yè)。使用 GitHub Pages...
在精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)時(shí)代,基因檢測(cè)技術(shù)已成為疾病診斷和治療的重要工具。其中,拷貝數(shù)變異(Copy Number Variation, CNV)檢測(cè)因其在臨床用藥指導(dǎo)中的關(guān)鍵作用而備受關(guān)...
import pandas as pdimport numpy as npimport matplotlib.pyplot as pltfrom mpl_toolkits.m...
安裝命令,可隨意起一個(gè)主機(jī)名 然后VScode的terminal 或 win +R ,cmd:輸入 wsl,及進(jìn)入linux命令界面 若不想進(jìn)入linux cmd界面,只...
交叉原理與基因重組距離計(jì)算 我們討論了交叉的原理。這節(jié)課上,我們將利用該原理來(lái)計(jì)算基因間的重組距離。隨后,你會(huì)看到我們?nèi)绾卫迷撛斫M建出基因組圖譜或是多個(gè)基因MAP。 基因...
在上一節(jié)中我們講到了基本的演化原理,以及為什么自然選擇推動(dòng)物種演化是數(shù)學(xué)性的必然。我們也提到了盡管人們對(duì)于生物演化有著不同的理解,演化學(xué)課程也被允許在各種學(xué)校里教授。這一講里...
講者M(jìn)ohamed Noor, 是杜克大學(xué)的一名教授 我很高興在此與你們談?wù)勥z傳與進(jìn)化 這第一條視頻我們來(lái)看看什么是進(jìn)化 ,我們會(huì)看到進(jìn)化的證據(jù) ,以及對(duì)批判進(jìn)化論的回應(yīng) 現(xiàn)...
應(yīng)用程序 本課程有一個(gè)免費(fèi)的應(yīng)用程序,可用于 iPhone 和安卓手機(jī)。您可以在這里找到更多相關(guān)信息[http://people.duke.edu/~noor/genevol...
@朝赤 Porechop:
Porechop是專門(mén)為納米孔測(cè)序數(shù)據(jù)設(shè)計(jì)的工具,用于切除接頭和其他低質(zhì)量區(qū)域。它可以自動(dòng)檢測(cè)并切除接頭序列。
GitHub鏈接: https://github.com/rrwick/Porechop
NanoFilt:
NanoFilt是一個(gè)輕量級(jí)的工具,主要用于過(guò)濾和修剪納米孔測(cè)序的FastQ文件。雖然它主要用于過(guò)濾,但也可以用于簡(jiǎn)單的接頭修剪。
GitHub鏈接: https://github.com/wdecoster/nanofilt
Nanopore測(cè)序及數(shù)據(jù)處理一、工作原理 新型納米孔測(cè)序法(nanopore sequencing);采用電泳技術(shù)。 Nanopore測(cè)序當(dāng)中的核心部件是這個(gè)由蛋白質(zhì)構(gòu)成的納米級(jí)的小孔,我...
高通量文庫(kù)構(gòu)建是現(xiàn)代基因組學(xué)研究中不可或缺的一部分,特別是在下一代測(cè)序(NGS)技術(shù)中。文庫(kù)構(gòu)建的質(zhì)量直接影響到后續(xù)測(cè)序的準(zhǔn)確性和數(shù)據(jù)分析的可靠性。以下是高通量文庫(kù)構(gòu)建的一般...
核酸提取是從生物樣品中分離和純化DNA或RNA的過(guò)程。這一過(guò)程對(duì)于分子生物學(xué)研究、基因診斷、基因工程等領(lǐng)域至關(guān)重要。核酸提取的方法多種多樣,但其基本原理相似,主要步驟包括細(xì)胞...
以下是完全來(lái)自AI的腳本,給到的指令是: python 腳本,柱狀圖,我有一個(gè)多年份的統(tǒng)計(jì)表,輸入文件第一列為橫坐標(biāo)“藥物”,輸入文件第二列及之后的列為每一年的數(shù)據(jù),每一行的...
以下是完全來(lái)自AI的腳本,給到的指令是:python 腳本,柱狀圖,我有一個(gè)多年份的統(tǒng)計(jì)表,輸入文件第一列為橫坐標(biāo)“藥物”,輸入文件第二列及之后的列為每一年的數(shù)據(jù),每一行的數(shù)...
使用python的模塊edlib,可實(shí)現(xiàn)要比較的兩種變異的全局比對(duì)(mode=“HW”),通過(guò)輸入要比較的兩種標(biāo)記的ref,alt;分別獲得對(duì)應(yīng)的全局比對(duì)后的格式,然后再做比...