遺傳圖譜產(chǎn)生的背景 20世紀(jì)開始現(xiàn)代遺傳學(xué)進(jìn)入了一個(gè)快速發(fā)展的時(shí)期，這時(shí)人們已經(jīng)認(rèn)識(shí)到生物性狀的遺傳由基因決定，而染色體又是作為基因的載體，整體遺傳給后代?；虻臄?shù)目往往很多...
IP屬地：廣東
-
遺傳圖譜構(gòu)建 -
windows下SRA Toolkit下載原始數(shù)據(jù)打臉時(shí)刻來了~~~~之前在Linux下用SRA Toolkit下載數(shù)據(jù)效果不好，所以，果斷的將它拉入了黑名單。但是最近下載數(shù)據(jù)，用windows版本的SRA Toolkit，...
-
生信小工具：Plink之實(shí)戰(zhàn)演練（2）
繼續(xù)上次的內(nèi)容，介紹完P(guān)link與其基本格式后，當(dāng)然就是到動(dòng)真格的時(shí)候，實(shí)戰(zhàn)演練，下面會(huì)通過例子和小伙伴們一起熟悉Plink的使用。 測試數(shù)據(jù)的下載 下載官方教程中使用的測試...
-
GWAS學(xué)習(xí)筆記（1）-何為GWAS一、何為GWAS？ GWAS（Genome-wide Association Study）是對多個(gè)個(gè)體在全基因組范圍的遺傳變異（標(biāo)記）多態(tài)性進(jìn)行檢測，獲得基因型，進(jìn)而將基因型...
-
GWAS - plink提取染色體位置范圍內(nèi)的SNP位點(diǎn)
一、首先學(xué)會(huì)打開文件 寫給像我一樣的小白，如果你手頭有bim、fam等文件，怎么查看呢？雙擊是不行的?。。。∈紫却蜷_terminal，cd到文件所在的目錄，然后使用vim命令...
-
R-4.0.5 環(huán)境下安裝R包ggpubr時(shí)，car無法安裝，quantreg無法安裝
測試環(huán)境R-4.0.5加載R包ggpubr時(shí)，總提示car包不存在， library(ggpubr)Error: package or namespace load fail...
-
群體結(jié)構(gòu)——PCA分析概念 PCA（principal components analysis）即主成分分析。主成分分析也稱主分量分析，旨在利用降維的思想，把多指標(biāo)轉(zhuǎn)化為少數(shù)幾個(gè)綜合指標(biāo)。 在統(tǒng)計(jì)...
-
GWAS 總體流程理解版
自己找了一些文章和視頻，先總結(jié)了一部分，后面再做補(bǔ)充和實(shí)操 一. 相關(guān)概念理解 （1）GWAS： 全稱“全基因組關(guān)聯(lián)分析”，使用統(tǒng)計(jì)模型找到與性狀關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)，用于分子標(biāo)記選擇...
