ClusterGVis包是中國藥科大學(xué)Jun Zhang博士開發(fā)的系列可視化工具包之一,前期該包主要設(shè)計用于Bluk-seq表達矩陣的處理,可同...
scRNAtoolVis適用于各種單細(xì)胞RNA-seq數(shù)據(jù)分析場景,包括但不限于:單細(xì)胞Marker基因表達熱圖:通過熱圖展示不同細(xì)胞亞群中Ma...
SMR(Summary data-based Mendelian Randomization)是一個針對匯總數(shù)據(jù)的孟德爾隨機化方法,可以基于GW...
人類參考基因組(如 GRCh37 和 GRCh38)由國際基因組學(xué)研究社區(qū)定期更新,以改進基因組的完整性和準(zhǔn)確性。每次更新可能會導(dǎo)致以下變化:?...
1. 什么是連鎖不平衡(LD)? 連鎖不平衡(Linkage Disequilibrium,LD)是指在基因組中,兩個或多個SNP(單核苷酸多態(tài)...
0. 數(shù)據(jù)準(zhǔn)備(加載自己需要轉(zhuǎn)換的數(shù)據(jù)) 1. 使用其他R包"AnnotationDbi"和"org.Hs.eg.db" ? 發(fā)現(xiàn)存在一個ENS...
轉(zhuǎn)錄因子(transcription factors, TFs)是指能夠識別、結(jié)合在某基因上游特異核苷酸序列上的蛋白質(zhì)。其通過介導(dǎo)RNA聚合酶與...
h5ad 是用于存儲單細(xì)胞 RNA 測序(scRNA-seq)數(shù)據(jù)的文件格式,常用于 Python 中的 Scanpy 軟件包。它基于 HDF5...
1. 數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 2. 數(shù)據(jù)整合