Basic local alignment search tool (BLAST) 包括：blastn, blastp, blastx, tblastn, tblastx等....
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這或許是我寫的最全的BLAST教程 -
單細(xì)胞數(shù)據(jù)挖掘3-clustering1. 寫在前面 參考教程：https://hbctraining.github.io/scRNA-seq/ 2. Normalization, variance stabil...
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理解Linux文件權(quán)限主要內(nèi)容： 理解Linux安全性 使用Linux組 解讀文件權(quán)限 1. Linux安全性 Linux安全系統(tǒng)的核心是用戶賬戶。每個(gè)能進(jìn)入Linux系統(tǒng)的用戶都會(huì)被分配唯一的用...
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TCGA學(xué)習(xí)02：差異分析TCGA學(xué)習(xí)01：數(shù)據(jù)下載與整理 - 簡(jiǎn)書 TCGA學(xué)習(xí)02：差異分析 - 簡(jiǎn)書 TCGA學(xué)習(xí)03：生存分析 - 簡(jiǎn)書 TCGA學(xué)習(xí)04：建模預(yù)測(cè)-cox回歸 - 簡(jiǎn)書...
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Matlab繪制帶置信區(qū)間的擬合曲線polyfit：基于最小二乘法，用于曲線擬合的函數(shù)。 polyval：求n次多項(xiàng)式p在x處的值的函數(shù)。 polyconf：對(duì)ployfit擬合曲線進(jìn)行評(píng)價(jià)和置信區(qū)間估計(jì)的函數(shù)...
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RNA-seq(7): DEseq2篩選差異表達(dá)基因并注釋(bioMart)============================================寫在前面：可以參考另外一篇《得到差異基因后怎么做？[https://www.jians...
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DESeq2的基本使用DEseq預(yù)熱 主要就是這幾個(gè)步驟了。 1. counts: 查看每個(gè)樣本在每個(gè)基因上的counts數(shù) 2. 構(gòu)建DESeqDataSet 3. run DESeq() & ...
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一篇PNAS Fig.1的復(fù)現(xiàn)文章鏈接：https://www.pnas.org/content/115/8/E1839.long GSE編號(hào)：GSE102339 特別提示：如果只是復(fù)現(xiàn)Fig1，不需要下...
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ATAC-seq上游分析
參考教程：生信技能樹(shù)ATAC-seq教程 1. 環(huán)境配置及軟件安裝 1.1. 安裝conda并配置鏡像 1.2. 創(chuàng)建小環(huán)境并安裝軟件 1.3. 軟件環(huán)境可以移植 2. （若...
