發(fā)簡信
IP屬地：遼寧
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DoubletFinder 去除雙細胞
1. 參考資料 https://mp.weixin.qq.com/s/ybr1rK5CcC-BfDKUYxKcNw https://www.ji...
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Motif 分析
1. Homer 1.1. homer的安裝和配置 按照這個鏈接里的教程進行。 1.2. install mm10 1.3. find moti...
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ATAC-seq 質(zhì)控1. 寫在前面 1 年前看技能樹在簡書的文字教程第一次跑 ATAC-seq 分析流程，當時還很懵懂，以為每一步只有一個工具，現(xiàn)在通過技能樹剛發(fā)在...
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單細胞數(shù)據(jù)挖掘3-clustering1. 寫在前面 參考教程：https://hbctraining.github.io/scRNA-seq/ 2. Normalization, ...
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技能樹直播課程學習-WGCNA-3-模塊與臨床性狀關聯(lián)1. 計算 ME 值 2. 計算模塊與性狀的相關性并可視化 3. 計算各基因表達量與模塊 ME 和性狀的關系（MM and GS）并可視化 GS...
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單細胞數(shù)據(jù)挖掘2-QC1. 寫在前面 參考教程：https://hbctraining.github.io/scRNA-seq/ 2. 搭建環(huán)境 在 Rproj 的位...
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技能樹直播課程學習-WGCNA-2-網(wǎng)絡構建和模塊檢測1. 挑選軟閾值 軟閾值的要求：無尺度拓撲網(wǎng)絡系數(shù) R^2 高于 0.85，或者或平均連接度降到 100 以下 如果沒有合適的閾值，可以使用 R...
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技能樹直播課程學習-WGCNA-1-數(shù)據(jù)清洗1. 層次聚類 在讀入表達矩陣，進行基礎的篩選，并使用 goodSamplesGenes() 確保沒有太多的缺失值后，我們對樣本進行聚類，以剔除...
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技能樹直播課程學習-WGCNA-0-基礎知識
1. 基本步驟 數(shù)據(jù)輸入和清洗 網(wǎng)絡構建和模塊檢測 量化模塊和樣本性狀的關系 挑出感興趣模塊內(nèi)部的基因 可視化TOM矩陣 將網(wǎng)絡導出到外部數(shù)據(jù)進...