轉錄因子（Transcriptionfactor，TF)是一種能與特異DNA序列結合的蛋白，可以單獨或與其他蛋白形成復合體，提高或阻斷特定基因對RNA聚合酶的招募，調控基因的...
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匯總 | 轉錄本表達矩陣 到 基因表達矩陣寫在前面 前天，我寫了一個 TBtools 插件，意在讓所有人都能自主分析轉錄組測序數據，進而獲得 基因表達量矩陣（TPM） 和 基因讀段計數矩陣（Count）。已經提過了，...
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GEO數據挖掘小嘗試：（二）蛋白質互作網絡分析在上一篇文章《GEO數據挖掘：（一）尋找共同差異基因》中我們通過兩個實驗的數據尋找到了一些差異基因，本篇文章將對這些差異基因的互作關系進行簡單的分析，用到的工具主要有Stri...
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生信寶典之傻瓜式(四)蛋白蛋白互作網絡在線搜索
歡迎關注生信寶典微信公眾號：http://mp.weixin.qq.com/s/JO1J66BtzuY-9a20x0XQcg傻瓜系列重啟了，今天要介紹的是一款在線查詢蛋白-蛋...
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基因表達分析（中）- 富集分析
回顧 首先對基因表達分析（上）做一個簡單的回顧 研究基因表達的有如下工具：RNA-Seq，microarray， qRT-PCR等（歡迎補充） RNA-Seq，microar...
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《生物信息學生R入門教程》讀書筆記 Chapter 7這一章來介紹NGS的下游分析 富集分析 簡單的講，富集分析就是一種統計分析的手段，用來篩選功能相類的一組基因是否富集中差異表達的基因中。當人們拿到了差異表達的基因時，很多時候...
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物種內共線性圈圖繪制，有那么難嗎？寫在前面 我受夠了！整天有人問，TBtools怎么畫這個圖 但是我其實只想回一句： 你畫這個圖干什么？有什么意義？你想說談什么生物學故事？ 承認吧，你什么都不知道，什么都沒搞...
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收藏貼-順式作用元件分布圖繪制
今天一起了解下順式作用元件分布圖如何繪制！ 上圖展示的是每個基因上游promoter區(qū)（基因位于負鏈則為下游，長度一般是起始密碼子前1500bp），順式作用元件種類及分布情況...
