作者，Evil Genius 生活總是坎坎坷坷，一點(diǎn)都不順，不是這兒拌一下，就是那兒磕破了。 目前visium低精度發(fā)表的文章，大約1500篇左右，其中包括方法文；而visi...
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文獻(xiàn)分享--空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)高分辨率繪制宿主-腸道微生物組生物地理分布圖 -
第18篇HD文章--基因背景漂變識(shí)別緩解癌癥治療耐藥的藥物靶點(diǎn)作者，Evil Genius 事業(yè)編考試臨近了，希望大家都可以考出好成績(jī)，成功上岸。 宇宙的盡頭是編制，這句話在科研領(lǐng)域，是鐵律，沒(méi)有編制托底，認(rèn)真搞科研無(wú)從談起。 今天我們...
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課前準(zhǔn)備--CODEX（IMC）基礎(chǔ)分析梳理作者，Evil Genius 我們也來(lái)到了空間蛋白組的課程范圍了。 為什么做了空間轉(zhuǎn)錄組，還要做空間蛋白組，也就是說(shuō)轉(zhuǎn)錄組和蛋白組的對(duì)應(yīng)關(guān)系如何，這個(gè)多次在課程上談到了。 C...
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頂刊分享--協(xié)調(diào)的細(xì)胞鄰域在結(jié)直腸癌侵襲前沿增強(qiáng)抗腫瘤免疫（CODEX）作者，Evil Genius 今天我們分享文獻(xiàn)，看看細(xì)胞鄰域分析重要的生物學(xué)意義（CODEX）。 參考文獻(xiàn) 知識(shí)積累 抗腫瘤免疫需要免疫腫瘤微環(huán)境（iTME）組分之間有組織的...
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文獻(xiàn)分享---腫瘤微環(huán)境的空間解析基因表達(dá)譜揭示肺腺癌發(fā)展的關(guān)鍵步驟（scRNA + visium + xenium）作者，Evil Genius 生物信息，生物在前，技術(shù)為生物認(rèn)知服務(wù)，所謂生信人員，要經(jīng)常看文獻(xiàn)，總結(jié)經(jīng)驗(yàn)，學(xué)以致用，光會(huì)分析沒(méi)有用，要和課題，生物研究相結(jié)合才行。 今日參考...
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多樣本空間轉(zhuǎn)錄組分析異常組織結(jié)構(gòu)域作者，Evil Genius 單細(xì)胞空間外顯子課程這周第四課就結(jié)束了，感興趣的可以聯(lián)系。 今日參考文獻(xiàn) 從多樣本空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)(ST)數(shù)據(jù)中檢測(cè)和解剖異常組織結(jié)構(gòu)域(DDATD...
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單細(xì)胞空間多組學(xué)分析中的外顯子分析部分作者，Evil Genius 之前分享了很多關(guān)于多組學(xué)的內(nèi)容了，其中涉及到外顯子的部分分析呢，我基本都一筆帶過(guò)了，很多高分文章都運(yùn)用到了外顯子突變類(lèi)的信息分析，以下為文章示例...
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全外顯子組測(cè)序（WES）分析2: SigProfiler（突變特征分析）SigProfiler 提供一套全面、集成的生物信息學(xué)工具，用于執(zhí)行突變特征分析。該軟件涵蓋了從生成突變矩陣到特征提取的整個(gè)分析生命周期，以及繪圖和模擬支持功能。 1. Si...
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10X單細(xì)胞、空間、WES測(cè)序分析揭示腫瘤微環(huán)境進(jìn)化區(qū)域異質(zhì)性作者，Evil Genius 科研和臨床其實(shí)有很多共同的地方，大家都知道多組學(xué)是方向，目前單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組、ATAC、VDJ、空間轉(zhuǎn)錄組、空轉(zhuǎn)VDJ、宏基因組、外顯子等幾個(gè)方向...
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