1、準(zhǔn)備 2 個(gè)好文件 gene_expression.txt group.txt 2、如果你有數(shù)據(jù)，打開 https://db.cngb.org/genomics/tool...
發(fā)簡信
IP屬地：安徽
-
免費(fèi)的GESA在線工具 -
如何針對特定基因集做 GSEA 分析1、首先，前往 GSEA 官網(wǎng) https://www.gsea-msigdb.org/gsea/index.jsp ，點(diǎn)擊進(jìn)入「Molecular Signatures D...
-
下載R和RStudio一、打開下載https://www.r-project.org/ 二、選擇一個(gè) 三、按照默認(rèn)路徑自動(dòng)安裝成功后，打開試運(yùn)行 四、RStudio的下載 https://posi...
-
在曼哈頓圖上嵌入的苯分子結(jié)構(gòu)學(xué)個(gè)圖，事物都在更新，曼哈頓圖也是，基于ggpp在曼哈頓圖上加個(gè)分子結(jié)構(gòu)。 內(nèi)容一：在 ggplot2 繪圖中插入一張圖片（比如一個(gè)結(jié)構(gòu)圖或 LOGO）作為裝飾元素 代碼用 ...
-
RF Diffusion最強(qiáng)擴(kuò)散式蛋白設(shè)計(jì)模型RF Diffusion 是由華盛頓大學(xué)等機(jī)構(gòu)開發(fā)的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)生成模型，結(jié)合了 RoseTTAFold 的結(jié)構(gòu)預(yù)測能力與擴(kuò)散模型的生成能力，能夠在多種設(shè)計(jì)任務(wù)中表現(xiàn)出色。其核...
-
AlphaFold3（AF3）使用指南AlphaFold3（AF3）既可以通過在線平臺使用，也可在本地部署運(yùn)行。在線平臺開箱即用，每個(gè)賬號每天最多提交20個(gè)預(yù)測任務(wù)。AF3 最大的亮點(diǎn)在于它可以預(yù)測由蛋白質(zhì)、核酸...
-
-
Nature同款曼哈頓圖今天給大家分享一個(gè)Nature同款曼哈頓圖 模仿的是：Fig. 2: Manhattan plot and spatial mapping of the associatio...
-
繪制基因簇和轉(zhuǎn)錄本的 R 包及5種可視化最近在用一款R包geneviewer，很不錯(cuò)分享給大家。 許多朋友私信詢問如何繪制基因簇和轉(zhuǎn)錄本。在此，我推薦使用 geneviewer，這是一款專門用于繪制基因簇和轉(zhuǎn)錄本的...
-
大家有感興趣的圖或者分析可以留言，后面更新今天學(xué)習(xí)這個(gè)吧~ 1、準(zhǔn)備所要用的包和工具 2、數(shù)據(jù)處理 3、繪制基礎(chǔ)圖 4、潤色圖片 生物信息學(xué)領(lǐng)域非常廣泛，難以一次說盡。我們下次繼續(xù)更新，一起深入學(xué)習(xí)生物信息學(xué)的內(nèi)容！...
-
@熬夜拜拜bye_bye https://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/能打開的
順式調(diào)控元件-數(shù)據(jù)分析模塊（上）
基因啟動(dòng)子順式元件分析是研究基因表達(dá)調(diào)控的重要手段之一。 基因啟動(dòng)子（promoter）是位于基因上游的一段DNA序列，負(fù)責(zé)調(diào)控基因的轉(zhuǎn)錄。啟動(dòng)子中包含許多特定的DNA序列，...
-
學(xué)習(xí)ggmapcn高效繪制精美地圖在生物學(xué)和植物學(xué)研究中，地圖作為展示物種分布、分析生態(tài)環(huán)境關(guān)系以及追蹤動(dòng)態(tài)變化的重要工具，具有不可或缺的作用。 通過地圖，研究人員能夠直觀地呈現(xiàn)植物物種的地理分布范圍，深入探...
-
-
WGCNA(一文完整流程：文獻(xiàn)、步驟、理論）一、文獻(xiàn) WGCNA（Weighted Gene Co-expression Network Analysis，加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析）是一種用于挖掘高維基因表達(dá)數(shù)據(jù)的系統(tǒng)生...
-
-
繪制SNP密度分布圖SNP密度圖是一種常用的遺傳學(xué)數(shù)據(jù)可視化工具，主要用于直觀展示單核苷酸多態(tài)性（SNP）在基因組上的分布密度。 通過該圖，研究者可以有效地分析SNP在不同染色體或基因組區(qū)域的分...
-
蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)PPI的可視化一、力導(dǎo)向布局（Force-directed Layout）： 力導(dǎo)向布局可以通過模擬物理力（例如斥力和引力）來擺放節(jié)點(diǎn)，使得相互作用較強(qiáng)的蛋白質(zhì)會(huì)被拉得更近，反之則相隔更遠(yuǎn)...
-
蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)PPI蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)可以幫助我們探索基因家族與哪些蛋白相互作用，挖掘出豐富的信息。不僅限于基因家族，差異表達(dá)基因、免疫、脅迫、藥物響應(yīng)相關(guān)基因等，都能通過PPI分析發(fā)現(xiàn)許多有趣的故...
-
提取所有擬南芥（Arabidopsis thaliana）WRKY基因的ID為了提取所有擬南芥（Arabidopsis thaliana）WRKY基因的ID，我們可以使用Ensembl Plants或TAIR數(shù)據(jù)庫提供的工具，或者直接從相關(guān)的基因組數(shù)...