前言 最近專(zhuān)注于貝葉斯方法的學(xué)習(xí)，發(fā)現(xiàn)在強(qiáng)化學(xué)習(xí)領(lǐng)域有一本入門(mén)書(shū)籍，統(tǒng)計(jì)學(xué)反思 未來(lái)時(shí)間會(huì)將這本書(shū)的學(xué)習(xí)筆記持續(xù)上傳至我的博客等地方 Statistical Rethinki...
IP屬地：江西
-
2020-09-19-統(tǒng)計(jì)學(xué)反思Statistical Rethinking -
2020-08-11-體細(xì)胞calling 算法綜述
體細(xì)胞calling 算法綜述 somatic single nucleotide variant calling algorithms paper基本信息 paper na...
-
@YangKD_ 對(duì)兩種看情況是沒(méi)有影響的
2020-06-06-T檢驗(yàn)-計(jì)算TMB兩種方式差異
TMB去除同意突變與非同義突變的差異 取樣一組樣本去重并且去除不合格樣本后剩余427例樣本其中同意第一種使用非同義突變計(jì)算數(shù)據(jù)取一個(gè)header，看看先 第二種使用同意突變計(jì)...
-
2020-06-09-FACETS Testing CNVFACETS facets is CNV detection software with using the ascn principle input first Let’s...
-
2020-06-06-T檢驗(yàn)-計(jì)算TMB兩種方式差異TMB去除同意突變與非同義突變的差異 取樣一組樣本去重并且去除不合格樣本后剩余427例樣本其中同意第一種使用非同義突變計(jì)算數(shù)據(jù)取一個(gè)header，看看先 第二種使用同意突變計(jì)...
-
2020-06-06-驅(qū)動(dòng)基因背景 腫瘤基因組學(xué)目前面臨的挑戰(zhàn)之一是將腫瘤形成過(guò)程中所涉及的基因組變化（即驅(qū)動(dòng)因素）與對(duì)癌細(xì)胞沒(méi)有任何益處的基因組區(qū)分開(kāi)來(lái)。癌癥形成的過(guò)程中驅(qū)動(dòng)基因（即那些帶有驅(qū)動(dòng)因子變化...
-
-
2020-05-18-SQL入門(mén)操作創(chuàng)建數(shù)據(jù)庫(kù)文件 文件-新建連接-sqllite-新建sqllite3-數(shù)據(jù)庫(kù)文件-選擇存放位置 導(dǎo)入數(shù)據(jù) 下載文件這是數(shù)據(jù)分析師的excel實(shí)戰(zhàn)數(shù)據(jù)的下載地址： https:...
-
2020-05-11Strand bias 鏈偏好Strand bias 鏈偏好 背景 造成鏈偏好的原因： 1.Local realignment目的就是將比對(duì)到indel附近的reads進(jìn)行局部重新比對(duì)，將比對(duì)的錯(cuò)誤率降到...
-
2020-05-11-MSI算法-msisensor計(jì)算原理
MSI msisensor 計(jì)算msi原理 MSI突變中重復(fù)至少5次的1-5個(gè)堿基的序列。然后，使用MSIsensor msi命令，通過(guò)使用卡方檢驗(yàn)比較腫瘤和正常樣品之間的讀...
-
學(xué)習(xí)如何分析病毒Learn to analyze data from a viral outbreak
簡(jiǎn)介 在這個(gè)疫情時(shí)間，我們來(lái)學(xué)習(xí)如何用生物信息學(xué)方法檢測(cè)病毒，根據(jù)系統(tǒng)發(fā)育，將該病毒識(shí)別為嚴(yán)重急性呼吸系統(tǒng)綜合癥冠狀病毒SARS-CoV的同源，covid-19基因組由大約3...
-
2020-01-06 記錄自己的沙雕
手賤 網(wǎng)上搜索了得用U盤(pán)重置系統(tǒng)，我嘗試過(guò)拯救，但是作為一個(gè)對(duì)linux系統(tǒng)了解不深的人，我表示很無(wú)力，因此我考慮了自己的數(shù)據(jù)后決定重裝，對(duì)習(xí)慣進(jìn)行一次糾正1.以后只使用co...
-
IGV截圖工具，可自動(dòng)化
IGV配置會(huì)有些麻煩腳本https://github.com/PdoraB/DiffPdoraBox/blob/master/IGVplot/igv_Screenshot.p...
-
撿幾個(gè)有意思的講講
廣東生物信息學(xué)研討會(huì) 學(xué)習(xí)記錄
前提這次研討會(huì)的內(nèi)容很豐富，作為一個(gè)生信的初學(xué)者，一次性灌輸這些內(nèi)容有些太多，做個(gè)寫(xiě)個(gè)文章記錄一下。表示聽(tīng)過(guò) 廣東生物信息學(xué)研討會(huì) 11月9日內(nèi)容 第一講 清華生命科學(xué)院 張...
-
廣東生物信息學(xué)研討會(huì) 學(xué)習(xí)記錄前提這次研討會(huì)的內(nèi)容很豐富，作為一個(gè)生信的初學(xué)者，一次性灌輸這些內(nèi)容有些太多，做個(gè)寫(xiě)個(gè)文章記錄一下。表示聽(tīng)過(guò) 廣東生物信息學(xué)研討會(huì) 11月9日內(nèi)容 第一講 清華生命科學(xué)院 張...
-
-
只能通過(guò)放大方格來(lái)實(shí)現(xiàn)不是很好弄
pheatmap 畫(huà)NA值熱圖與 image 畫(huà)三角統(tǒng)計(jì)分析圖
前言：生物信息工作中各種熱圖層出不窮，介紹兩種特殊的熱圖畫(huà)法1.含有NA數(shù)據(jù)的熱圖 數(shù)據(jù)格式如上圖所示python 中用pandas 處理一下數(shù)據(jù) 熱圖用R pheatmap...
