1、LD連鎖不平衡介紹 （1）LD連鎖不平衡介紹 連鎖不平衡指的是在某一群體中，兩個基因同時遺傳的頻率大于隨機組合的頻率。 用于衡量連鎖不平衡程度的指標主要有D、D'和r2三...
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群體進化分析--基因流及群體歷史分析——我愿稱之為史上最全基因流（也稱基因遷移）是指從一個物種的一個種群向另一個種群引入新的遺傳物質，從而改變群體“基因庫”的組成。通過基因交流向群體中引入新的等位基因，是遺傳變異一個非常重要的來源，...
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10.GWAS：LD decay(LD衰減）—— PopLDdecay關于連鎖不平衡的詳細介紹在之前的帖子里有說過，這里就不再贅述，本篇主要介紹LD decay的計算。1.GWAS：原理與目的 - 簡書 (jianshu.com)[https:...
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混合（Pooling）樣本測序研究1.混合測序基礎 測序成本雖然下降了，但對于植物育種應用研究來說還是很高，動不動就上百群體，小小植物個體價值又低，測完了很可能后面就用不到了。這時，混合樣本測序是一種省錢的好...
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FDR 和 q-value
| 轉載自G. Corey Shan 的 FDR 和 q-value 最近在做一個肝癌預測的項目，建模使用的數(shù)據(jù)源在The Cancer Genome Atlas (TCGA...
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跟著Nature Communications學作圖:R語言ggplot2畫世界地圖并用md語法添加文字標簽論文 MiDAS 4: A global catalogue of full-length 16S rRNA gene sequences and taxonomy for ...
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Perl單行（Perl One-Liners）命令
Perl語言的一大好處就是，在日常處理各種小任務時，可以利用Perl單行的各種內置變量和參數(shù)快捷實現(xiàn)。本文記錄平時做分析時常用的perl內置變量、基本參數(shù)和一些常用命令。 個...
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跟著GlobalChangeBiology學作圖:R語言ggplot2點線圖(2)給分面添加注釋論文 Changes in plant inputs alter soil carbon and microbial communities in forest 本地pdf ...
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【R語言】R包dplyr(一):數(shù)據(jù)轉換
日常在工作中會碰到很多數(shù)據(jù)批量處理的問題，有的時候單獨造輪子很費時間，這個時候我發(fā)現(xiàn)了dplyr這個R包，能幫助你解決數(shù)據(jù)處理中的絕大多數(shù)難題。dplyr是tidyverse...
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