@雨后漣漪 您好，可能是github地址問題，您這邊可以提供一個(gè)郵箱，我這邊將軟件包發(fā)給您
進(jìn)化樹構(gòu)建與節(jié)點(diǎn)名批量修改今天介紹的小工具是Multi-omics Hammer的ptree_rename功能，主要用于批量修改進(jìn)化樹節(jié)點(diǎn)的名稱。 提到進(jìn)化樹，必然需要提到如何構(gòu)建進(jìn)化樹，因此本文將從...
發(fā)簡信
IP屬地：廣東
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docker版ubtuntu的使用一 起因 有些開源軟件需要編譯程序，改變系統(tǒng)環(huán)境，從而實(shí)現(xiàn)其對應(yīng)功能。然后，當(dāng)系統(tǒng)環(huán)境改變之后，筆者運(yùn)行的其他程序可能會受到影響，進(jìn)而需要重新調(diào)整（無用的折騰）。因此，筆者建...
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在pypi上快速發(fā)布你的python包一 起因 起因很簡單，實(shí)驗(yàn)室的小伙伴寫的新算法需要在論文發(fā)表的同時(shí)發(fā)布到的網(wǎng)上，因此有了以下的過程。 二 調(diào)用 第一步，package的發(fā)布需要再系統(tǒng)層面完成兩步：build...
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docker鏡像之RoseTTAFold運(yùn)用一 RoseTTAFold簡介 官方介紹：RoseTTAFold能夠解決具有挑戰(zhàn)性的X射線晶體學(xué)和低溫電鏡建模問題，在缺乏實(shí)驗(yàn)確定的結(jié)構(gòu)的情況下提供對蛋白質(zhì)功能的洞察力，并迅...
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docker鏡像之a(chǎn)lphafold運(yùn)用一 alphafold簡介 alphafold2應(yīng)該算是徹底改變計(jì)算生物學(xué)在生物學(xué)家心中地位的利器了。這是一個(gè)可以媲美冷凍電鏡的人工智能算法，在諸多生物學(xué)領(lǐng)域得到了應(yīng)用。比...
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精美網(wǎng)絡(luò)圖繪制《一》之python包: Networkx----補(bǔ)充到今天十一假期就基本結(jié)束了，大家過的怎么樣呢。接下來的一周可是恐怖的七天上班，大家開不開心呢。 接下來，就由bug開始新的一周吧。 一 問題 在之前的推文《精美網(wǎng)絡(luò)圖繪制《一...
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如何不污染服務(wù)器的python的包環(huán)境？？
一 問題 為啥突然有這篇推文呢？主要是最近在用服務(wù)器運(yùn)行一些程序的時(shí)候出現(xiàn)了以下情形： 哎，明明上次這個(gè)腳本還能運(yùn)行的，為啥這次突然不行？ 腳本沒問題呀，也沒有修改過 明白了...
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數(shù)據(jù)分析之經(jīng)驗(yàn)教訓(xùn)二上一篇推文，筆者有提到一些數(shù)據(jù)分析方面的經(jīng)驗(yàn)和教訓(xùn)。當(dāng)時(shí)想以編輯推薦的方式將近期的感悟也一并放上的。但是呢，由于設(shè)置的原因，最重要的部分并未介紹，這里一并補(bǔ)上。 首先，隨機(jī)數(shù)...
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圖一樂：如何使用機(jī)器學(xué)習(xí)成為具有藝術(shù)天分的畫家一 圖一樂之起因 有時(shí)呢，睡前刷公眾號，發(fā)現(xiàn)一篇推文報(bào)道一個(gè)不會作畫的人通過一個(gè)人工智能軟件實(shí)現(xiàn)了在眾多人類畫家奪冠的偉業(yè)（當(dāng)然，肯定不會像筆者這樣簡單）。于是，心生一念，要...
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ubtuntu服務(wù)器版本不停重啟與英偉達(dá)驅(qū)動安裝的問題
以下情況針對本服務(wù)器的版本安裝dkms后系統(tǒng)出現(xiàn)不停重啟的情況以及顯卡驅(qū)動安裝的情況 Linux version 5.4.0-125-generic (buildd@lcy0...
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搭建centos服務(wù)器過程中的具體步驟與避坑指南
一、centos服務(wù)器的安裝過程： 1，去centos官網(wǎng)下載對應(yīng)的系統(tǒng)文件 2，將U盤燒錄成系統(tǒng)盤 3，利用燒錄好的啟動U盤安裝系統(tǒng)（按F2進(jìn)行Bios） 4，安裝即將結(jié)束...
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R包介紹：使用ggalluvial繪制共線性圖（alluvial）一導(dǎo)言 共線性圖作為新近出現(xiàn)的一種數(shù)據(jù)可視化方式，以其直觀、形象的方式受到大家的普遍歡迎，也在眾多文章中獲得了應(yīng)用。該圖的核心理念就是將不同時(shí)期間同一批數(shù)據(jù)的關(guān)系connec...
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算法淺談之KNN算法算法和數(shù)據(jù)，作為機(jī)器學(xué)習(xí)或者深度學(xué)習(xí)中最重要的兩把利劍，合力幫助人們解決許多無法靠人力或者簡單堆疊去解答的問題。然而，現(xiàn)如今的算法發(fā)展突飛猛進(jìn)，即使是再優(yōu)秀的人也不可能了解所...
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Multi-omics Hammer軟件之‘元素索引的批量查找’本篇推文則主要介紹Multi-omics Hammer軟件的另一個(gè)重磅功能：大文件的矩陣操作套件。使用這一套件可以進(jìn)行各種文件格式轉(zhuǎn)換，有效減少用戶處理文件格式的時(shí)間和精力。...
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Multi-omics Hammer軟件之批量元素的數(shù)量統(tǒng)計(jì)在之前的推文中我們分別介紹了如何利用這一套件來進(jìn)行批量索引查找和GO/KEGG注釋文件的格式整理，本推文繼續(xù)上面的內(nèi)容，介紹本套件的功能：批量元素的數(shù)量統(tǒng)計(jì)。 一功能開發(fā) 對...
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Multi-omics Hammer軟件之進(jìn)化樹節(jié)點(diǎn)名的批量修改今天的推文主要想介紹了一下如何使用Multi-omicsHammer軟件的Genome_relate工具箱的ptree_rename功能，批量修改進(jìn)化樹節(jié)點(diǎn)的名稱。 一功能開...
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Multi-omics Hammer軟件之基因長度計(jì)算上一篇推文主要介紹了一下Multi-omics Hammer軟件的Primer工具箱，本篇就介紹一下如何使用該軟件的Genome relate工具箱進(jìn)行基因長度的統(tǒng)計(jì)。更多內(nèi)...
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Multi-omics Hammer軟件之GO/KEGG富集分析文件的格式整理在《Multi-omics Hammer軟件之‘元素索引的批量查找’》推文中我們著重介紹了如何利用大文件的矩陣操作套件實(shí)現(xiàn)“元素索引的批量查找”功能。這篇推文主要介紹一下如何...
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Multi-omics Hammer軟件之Cytoscape_alig_plugin功能介紹一 功能開發(fā) 之前已經(jīng)在推文介紹了如何使用Aligment功能（《Multi-omics Hammer軟件之Aligment功能介紹》）。但是，發(fā)現(xiàn)這一功能的使用仍有許多局限...