1. 首先查看KEGG數(shù)據(jù)庫(kù) PI3K-AKT signaling pathway gene set 詳細(xì)說(shuō)明查看如何拿到 KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)的 hsa04650 Natural...
1. 首先查看KEGG數(shù)據(jù)庫(kù) PI3K-AKT signaling pathway gene set 詳細(xì)說(shuō)明查看如何拿到 KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)的 hsa04650 Natural...
老大讓復(fù)現(xiàn)的是一張韋恩圖,來(lái)自3個(gè)數(shù)據(jù)集,分別找每個(gè)數(shù)據(jù)集的差異基因,然后取UP和DOWN的交集。原文鏈接:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/...
摘要:新冠患者SARS-CoV-2 entry受體ACE2的表達(dá)比正常高了3倍,并與免疫細(xì)胞的干擾素表達(dá)相關(guān)。和中度患者相比,重癥患者顯示出更強(qiáng)的上皮細(xì)胞免疫細(xì)胞互作,引起免...
擬時(shí)間分析比較 http://genome.annoroad.com/News/Industry/1061.html https://mp.weixin.qq.com/s?_...
上節(jié)完成了擬時(shí)分析,剩下的內(nèi)容就比較簡(jiǎn)單了,只需要可視化。我們可視化一些一般文章中出現(xiàn)的圖。用到的文件是上節(jié)分析得到的cds文件。圖的主題可以結(jié)合ggplot2進(jìn)行修飾。 先...
單細(xì)胞數(shù)據(jù)挖掘?qū)崙?zhàn):文獻(xiàn)復(fù)現(xiàn)(一)批量讀取數(shù)據(jù)[http://www.itdecent.cn/p/c9da06d451b9]單細(xì)胞數(shù)據(jù)挖掘?qū)崙?zhàn):文獻(xiàn)復(fù)現(xiàn)(二)批量創(chuàng)建Seu...
基本函數(shù):sample_exp為不同年齡分組的表達(dá)矩陣 單細(xì)胞數(shù)據(jù)seurat_object:seurat_object_list為按照某個(gè)meta.data中的因素如cel...
從富集的結(jié)果中導(dǎo)出富集在通路中的基因 從GSEA富集的結(jié)果中導(dǎo)出富集在通路中的基因 從富集的結(jié)果中導(dǎo)出富集在所有GO中的基因 導(dǎo)出某個(gè)GO item中的所有差異基因 導(dǎo)出某個(gè)...
貝赫切特病(Behcet’s disease,BD),又名白塞病,是一種慢性血管炎,通常表現(xiàn)為復(fù)發(fā)性口腔/生殖器潰瘍和皮膚病變,以全身免疫異常為特征。然而,目前還缺乏對(duì)BD發(fā)...