發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：湖南
-
復(fù)現(xiàn)一篇WGCNA文章（含代碼）（五）前面我們已經(jīng)拿到了差異表達(dá)基因以及WGCNA與腫瘤最相關(guān)的兩個(gè)模塊里的基因，下面我們就從這些基因中找到文章標(biāo)題中的那3個(gè)關(guān)鍵基因：AURKA, ...
-
復(fù)現(xiàn)一篇WGCNA文章（含代碼）（四）接下來是對(duì)WGCNA分析的yellow模塊和turquoise模塊里的基因分別做GO和KEGG富集分析； 文章中是用R包c(diǎn)lusterprofi...
-
復(fù)現(xiàn)一篇WGCNA文章（含代碼）（三）找完差異基因后，現(xiàn)在開始這篇文章的WGCNA分析，這個(gè)分析最主要的是要得到與表型相關(guān)的基因； 先看看文章中怎么做的： 首先對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行過濾：過濾后...
-
復(fù)現(xiàn)一篇WGCNA文章（含代碼）（二）前面我們處理了表達(dá)矩陣以及臨床信息，下面開始做差異分析； 首先，我們看一下文章里是怎么做的： 這里讓我比較疑惑的是取|logFC|>1的話，并不...
-
復(fù)現(xiàn)一篇WGCNA文章（含代碼）（一）文章 AURKA, TOP2A and MELK are the key genes identified by WGCNA for the p...
-
【Python生信編程筆記】讀取文件
在Python中，讀取文件分為三個(gè)步驟: 一、打開文件：open 文件句柄不是文件，而是對(duì)文件的說明。 二、讀取文件：有幾個(gè)方法來讀取文件。 r...
-
【Python生信編程筆記】if、for以及while語句小例子
前面我們學(xué)習(xí)了數(shù)據(jù)類型以及if、for和while語句，下面，我們用剛剛學(xué)到的知識(shí)來編程序: 一、估計(jì)蛋白質(zhì)的凈電荷 在固定的pH值下，可以計(jì)算...
-
【Python生信編程筆記】while循環(huán)
有一條指令使while條件為假是非常重要的，否則，我們就會(huì)進(jìn)入一個(gè)無限循環(huán)。 退出while循環(huán)的一種方法是使用break。 Break用于脫離...
-
【Python生信編程筆記】for循環(huán)
for控制結(jié)構(gòu)允許重復(fù)執(zhí)行代碼，同時(shí)保留一個(gè)具有可迭代對(duì)象值的變量。 要知道你正在迭代的可迭代對(duì)象的位置，enumerate方法將返回可迭代對(duì)象...