發(fā)簡(jiǎn)信
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MetaX：探索微生物分類與功能(Taxon-Function)關(guān)聯(lián)的宏蛋白質(zhì)組學(xué)綜合分析平臺(tái)MetaX是一款專為宏蛋白質(zhì)組學(xué)（Metaproteomics）設(shè)計(jì)的開源工具，能夠?qū)㈦男蛄信c分類學(xué)和功能信息相結(jié)合，以幫助研究人員解答微生物在...
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Python爬蟲，批量獲取知網(wǎng)文獻(xiàn)信息一、前言 最近臨近畢業(yè)，寫畢業(yè)論文需要從知網(wǎng)查找大量的文獻(xiàn)。但去知網(wǎng)一條一條進(jìn)去看摘要又略顯麻煩和浪費(fèi)時(shí)間。于是，反手寫一個(gè)爬蟲，批量獲取基本信...
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選擇壓力分析，從序列下載到結(jié)果繪圖選擇壓力及基因在進(jìn)化過程中所受到的壓力，也稱自然選擇。 在遺傳學(xué)中， Ka/Ks或者dN/dS表示的是非同義突變頻率(Ka)和同義突變頻率（Ks...
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用Python提取FASTA中最長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄本在對(duì)拼裝或者數(shù)據(jù)庫(kù)下載的序列文件進(jìn)行下一步分析時(shí)，我們通常會(huì)對(duì)序列進(jìn)行去冗余操作，其中經(jīng)常需要提取同一個(gè)‘gene’的最長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄本，所以動(dòng)手用py...
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OrthoFinder尋找同源基因并建樹提到尋找物種之間的同源基因，大家一般想到的是OrthoMCL (http://orthomcl.org/orthomcl/） ，OrthoMCL...