軌跡分析系列： 單細胞之軌跡分析-1：RNA velocity[http://www.itdecent.cn/p/ee0f7a8e6a06] 單細胞之軌跡分析-2：mono...
IP屬地：湖南
-
單細胞之軌跡分析-5：slingshot -
R Package Scissor 學習筆記簡介Scissor R包提出的Scissor算法(function Scissor)，這是一種新穎的單細胞數(shù)據(jù)分析方法。利用批量（bulk）表型從單細胞測序(scRNA-se...
-
GWAS分析-說人話（15）- 如何查看SNP所在的基因前言 當我們獲得一堆“感興趣”/“有意義”的SNPs之后， 怎樣知道這些SNPs所在的基因呢？ 不要告訴我一個一個在pubmed查就好～ 我們需要知道Plink哪個參數(shù)可以幫...
-
-
孟德爾隨機化推斷暴露因素與健康結局的因果關系1. 孟德爾隨機化方法 傳統(tǒng)觀察性流行病學研究在發(fā)現(xiàn)疾病病因以及因果推斷中存在諸多挑戰(zhàn)，比如反向因果關聯(lián)、潛在混雜因素、微效暴露因素以及多重檢驗等，當研究者訴諸于隨機對照試驗...
-
MTAG(multi-trait analysis of GWAS)又開始一個新的軟件啦，大家是否有需要的？可以同一人群的不同trait做。咱們就開始吧~官網(wǎng)地址：URLs. MTAG software is available at htt...
-
生信筆記5-GWAS與eQTL引言 GWAS與eQTL都是用于研究基因位點與表型之間關系的手段，彼此之間存在很多的區(qū)別與聯(lián)系。 GWAS 全基因組關聯(lián)分析（Genome Wide Association ...
-
群體遺傳分析—LD連鎖不平衡本文轉載于百邁克云(https://www.sohu.com/a/234594093_761120) 在群體遺傳學研究中，LD連鎖不平衡分析是最常見的分析內(nèi)容，也是關聯(lián)分析的...
-
WGS全基因組分析||VCFTOOLS使用
寫在前面：當學習某一重要文件格式時，更需要對此格式對應軟件工具進行全面的學習（如sam/bam——samtools）。在多次花時間寫腳本處理文件之后發(fā)現(xiàn)，80%左右的任務其實...
