作者，Evil Genius 人生多艱，且行且珍惜 這一篇我們來分享一個(gè)關(guān)于單細(xì)胞空間數(shù)據(jù)分析共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)的方法----hdWGCNA，文章在hdWGCNA identifie...
IP屬地：上海
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針對高維數(shù)據(jù)（10X單細(xì)胞空間）的共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析（hdWGCNA） -
差異基因展示之對稱散點(diǎn)圖距離上一次寫簡書已經(jīng)有兩個(gè)月了，這兩個(gè)月我可是過著昏天黑地的分析數(shù)據(jù)的日子，單細(xì)胞數(shù)據(jù)真TM.....太復(fù)雜了！偶爾看了一下我上一篇文章閱讀量已經(jīng)快過千了，心里很高興，就想著...
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R數(shù)據(jù)可視化22:怎么獲取CNS級顏色搭配雖然對于大部分的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)而言，可能往往只涉及到幾組，即需要集幾種顏色，然而在組學(xué)分析中則常常可能會需要數(shù)十種甚至更多的顏色來表示不同的物質(zhì)。那么如何在R中選擇好看的顏色呢？ ...
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10×單細(xì)胞測序分析練習(xí)（二）接著上篇繼續(xù)練習(xí)，前一篇文章里已經(jīng)把PBMC按照4個(gè)時(shí)間點(diǎn)分了群，接下來就是差異分析了。本次使用monocle進(jìn)行差異分析，主要分10步（使用monocle做擬時(shí)序分析（單細(xì)...
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一致性聚類ConsensusClusterPlus介紹 一致性聚類是一種為確定數(shù)據(jù)集中可能的聚類的數(shù)量和成員提供定量證據(jù)的方法，例如作為微陣列基因表達(dá)。這種方法在癌癥基因組學(xué)中得到了廣泛應(yīng)用，在那里發(fā)現(xiàn)了新的疾病分子亞類。 ...
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Trimmomatic：用于Illumina NGS數(shù)據(jù)的靈活讀取修剪工具數(shù)據(jù)質(zhì)控軟件：官網(wǎng)：http://www.usadellab.org/cms/index.php?page=trimmomatic手冊：http://www.usadella...
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Bioconductor分析芯片數(shù)據(jù)并提取差異表達(dá)基因分析基因芯片的數(shù)據(jù)，提取出差異表達(dá)的基因這次試驗(yàn)的數(shù)據(jù)來源于文獻(xiàn)：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE...
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你還在為基因芯片表達(dá)差異分析發(fā)愁嗎？這個(gè)方法帶你飛！Hello，大家好！此前，小編給大家介紹了：如何從GEO數(shù)據(jù)庫下載芯片數(shù)據(jù)及相關(guān)樣本處理信息等等（不知道的可以戳這里哦）。這些芯片數(shù)據(jù)下載下來干嘛呢？下載必然是為了挖數(shù)據(jù)啦！...
