2022年4月，TCGA數(shù)據(jù)庫進(jìn)行了一次更新，原來的HT-RNASeq數(shù)據(jù)被替換成了Star-RNASeq，這導(dǎo)致原有的TCGAbiolinks包能正常下載數(shù)據(jù)，但是不能用G...
IP屬地：陜西
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TCGAbiolinks包報(bào)錯(cuò)：“Can't subset columns past the end”
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全外顯子測序（WES）分析流程
首先創(chuàng)建一個(gè)項(xiàng)目目錄wes和存放每個(gè)步驟生成文件的子目錄raw, clean, align, genome, hg19_VCF 此流程包含兩個(gè)raw外顯子測序文件：wes.1...
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Aspera Connect，高速下載sra數(shù)據(jù)
一、下載安裝Aspera Connect Linux系統(tǒng)下的Aspera Connect安裝（Windows下的Aspera Connect安裝參考）。查看最新版本的Aspe...
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【r<-包】ComplexHeatmap（4）：熱圖注釋Author: Zuguang Gu ( z.gu@dkfz.de )翻譯：詩翔Date: 2018-10-30 圖形注釋非常常用。熱圖注釋唯一相同的特征是它們對(duì)齊熱圖的列或...
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我的ChIP-Seq(1): FastQC報(bào)告解讀新手，剛做完一個(gè)ChIP-Seq項(xiàng)目的分析，來記錄一下，會(huì)分好幾篇。 首先是下機(jī)數(shù)據(jù)fastqc之后會(huì)生成一個(gè)html格式的報(bào)告，根據(jù)報(bào)告可以看出自己數(shù)據(jù)的特點(diǎn)，便于之后cl...
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?；鶊D怎么看怎么畫（附R代碼）什么是?；鶊D ?；鶊D（Sankey diagram），即?；芰糠至鲌D，也叫?；芰科胶鈭D。它是一種特定類型的流程圖，圖中延伸的分支的寬度對(duì)應(yīng)數(shù)據(jù)流量的大小，比較適用于用戶流...
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ChIP-seq基本分析流程歡迎關(guān)注天下博客：http://blog.genesino.com/2018/03/chip-pipeline/前年在中科院做培訓(xùn)時(shí)，整理了一套ChIP-seq分析流程，截選...
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R語言爬蟲入門-rvest教程
安裝包 查看rvest包的詳細(xì)信息 包的用法： read_html() 讀取html文檔的函數(shù)，其輸入可以是線上的url，也可以是本地的html文件，甚至是包含html的字符...
