PSVGT 不只是把 SV 找出來(lái),還進(jìn)一步告訴你這些 SV 可能有什么生物學(xué)影響,以及哪些 SV 可以直接轉(zhuǎn)化成實(shí)驗(yàn)可用的分子標(biāo)記。 可以分成...
PSVGT 不是單純“找 SV”,而是在解決三個(gè)老問(wèn)題:同一區(qū)域多個(gè)等位 SV 怎么分開、低覆蓋/覆蓋不均時(shí)閾值怎么定、短讀長(zhǎng)怎么盡量像長(zhǎng)讀長(zhǎng)一...
這篇文章的核心問(wèn)題是:現(xiàn)代玉米育種幾十年來(lái),一邊提高產(chǎn)量和農(nóng)藝性狀,一邊是否也在積累“有害突變”?這些有害突變又如何影響雜種優(yōu)勢(shì)和性狀? 論文信...
等位基因表達(dá)和亞基因組偏向影響栽培雜交甘蔗的株高 摘要 優(yōu)化株高以提高抗倒伏能力和促進(jìn)機(jī)械化收獲是栽培雜交甘蔗的一個(gè)關(guān)鍵育種目標(biāo)。然而,由于甘蔗...
我看測(cè)了幾百份栽培甘蔗數(shù)據(jù) 以及組裝了POJ甘蔗基因組。有意思的事 作者還測(cè)了 MAS-seq 數(shù)據(jù) SRX32681410 是 POJ287...
你的理解基本對(duì):它不是“完全從頭寫了一個(gè)新的 variant caller”,更像是把多個(gè)已有工具組織成一個(gè)新的 pangenome-based...
一句話: ?? 用最新的“完整人類基因組(T2T)”數(shù)據(jù),系統(tǒng)研究 HLA 的結(jié)構(gòu)變異 + 表達(dá) + 進(jìn)化 具體做了 4 件大事: 1?? 構(gòu)建 ...