大家好,這一次我們來分享一下有關(guān)做10X空間轉(zhuǎn)錄組的分析軟件SPATA,其實關(guān)于10X空間轉(zhuǎn)錄組做軌跡分析的文章之前分享過一個,文章在10X空間轉(zhuǎn)錄組的軌跡分析[https:...
我們做過單細胞的童鞋們來說,軌跡分析并不陌生,然而如果將單細胞的軌跡分析結(jié)果運用到空間轉(zhuǎn)錄組上,就可以幫助我們了解到細胞隨著時間進行的過程中,細胞位置的遷移。其中最常用的方式...
hello,大家好,今天禮拜天,天津霧霾嚴重,呆在家里學習一下吧。今天給大家分享的是空間轉(zhuǎn)錄組的空間細胞密度的分析,這個分析非常重要,下面是一張展示圖。 大家應(yīng)該都有基本的常...
hello,周四了,時間怎么過的這么快呢??我的記憶還停留在剛過完年拔充電線的那一刻,時間啊,慢些吧,想靜靜的感受一下生活的美好,雖然生活總是打擊我們,但我們還是要擁抱生活,...
hello,大家好,又是周五,一周又將過去了,時間總是匆匆,片刻不停留,我們唯一能做的,就是在時間流逝的過程中,留下點印記,雖然我們窮,找不下對象,但是過的開心也是成功~~~...
這一篇我們做一個詳細的總結(jié),周五了,疫情還沒結(jié)束,父母也都老了,有時候真的感覺身為兒子實在不孝,常年在外,回家很少,家里有點事父母也不會跟我這個兒子說,小病小災(zāi)的也舍不得去醫(yī)...
hello,又是一周,周二了,最近事情很多,所以祝大家生活快樂,我們來繼續(xù)看一下10X單細胞空間聯(lián)合分析的內(nèi)容,參考文獻在Benchmarking spatial and s...
作者,追風少年i~ 高考第二天,去看了一下在今天高考的數(shù)學卷子,驚奇的發(fā)現(xiàn)最后的壓軸題自己還會做,?? ,大家不妨試一試,題在下面 以前學數(shù)學的時候總是覺得生活中根本用不到,買...
作者,追風少年i hello,大家好,周五了,馬上大家就可以過一個美好的禮拜天了,不過現(xiàn)在還是工作的時間,今天分享一個分析細胞類型空間依賴性的代碼,分析的結(jié)果如下圖所示: 談...
在空間轉(zhuǎn)錄組之前,我們可以利用單細胞數(shù)據(jù)進行推斷CNA,用到的軟件就是inferCNV,至于inferCNV的原理,我們這里就不詳細敘說了,大家可以看文章InferCNV: ...
hello,大家好,今天我們來分享一個新的內(nèi)容,CNV事件的空間圖譜,其中關(guān)于10X空間轉(zhuǎn)錄組進行CNV事件分析的內(nèi)容,之前都分享過,文章在10X空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析之思路總結(jié)...
作者,追風少年i hello,大家好,新的一周,新的開始,腦海里浮現(xiàn)周星馳的一句臺詞,只有越來越強大,才能越來越童話。 今天我們簡單來學習一個簡單的內(nèi)容,腫瘤進化樹,先看示例...
作者,Evil_Genius 隔離的第三天,真的是讓人無語,沒事非要隔離干什么。 今天我們繼續(xù)回顧有關(guān)空間CNV的分析,CNV的分析我寫了很多,包括原理,方法與可視化,列在下...
作者,追風少年i 七夕馬上就要到了,古人描寫七夕的詩句很多,不過小時候背的就記得一首 迢迢牽牛星,皎皎河漢女。纖纖擢素手,札札弄機杼。終日不成章,泣涕零如雨。河漢清且淺,相去...
不想上課,進群找你玩兒可以嗎,學習學的頭禿??
空間轉(zhuǎn)錄組課表經(jīng)過上次課,發(fā)現(xiàn)大多數(shù)人還是需要帶著跑一跑代碼和講解代碼分析過程的注意事項,吸取上次的教訓,空轉(zhuǎn)課表,對課程進行細化,帶大家分析空間轉(zhuǎn)錄組和分析代碼,以及代碼過程中的注意事項...
最近一段時間更新的少,是因為自己搜集經(jīng)典marker的工作接近尾聲了,所以花了比較長的時間整理和總結(jié),我自己拿了幾個數(shù)據(jù)測試了一下,基本上效果不錯,用搜集到的marker配合...