使用corrplot包繪制相關(guān)性圖 加載所需R包 基本使用 使用示例
IP屬地：浙江
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通過NCBI下載mRNA的序列
最近需要獲得一批引物，直接交給公司設(shè)計較慢，設(shè)計過程中需要獲得mRNA的序列，于是稍微學(xué)習(xí)了一下，現(xiàn)記錄一下。 先是登陸NCBI網(wǎng)站主頁：https://www.ncbi.n...
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R也可以計算保守性得分(phastCons100way.UCSC.hg19)
看文獻時，翻到一張保守性得分圖： 圖片來源：Reducing the structure bias of RNA-Seq reveals a large number of ...
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雙曲線火山圖一鍵拿捏日常瞎掰 ??火山圖作為展示差異基因的首選，可以說是生信分析常見的圖形了。常規(guī)的火山圖會在x、y軸方向上添加垂直參考線，以方便區(qū)分滿足閾值的差異基因。常規(guī)的火山圖這里就不多了...
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從fasta文件中批量提取特定序列
如題，目的是從fasta文件中批量提取特定的基因序列.實現(xiàn)辦法有幾種： perl腳本：CSDN博主「little^raccoon」的原創(chuàng)文章perl實現(xiàn)根據(jù)序列ID從提取fa...
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跨物種同源基因轉(zhuǎn)換（biomaRt和homologene）2022-06-17
適用背景 當(dāng)我們進行跨物種比較分析時會發(fā)現(xiàn)基因名對不上，或者找不到基因，這時候就需要進行物種間的同源基因轉(zhuǎn)換。最常用的工具就是Ensembl的biomaRt，另外還查到NCB...
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set.seed()
set.seed()用于設(shè)定隨機數(shù)種子，一個特定的種子可以產(chǎn)生一個特定的偽隨機序列，這個函數(shù)的主要目的，是讓你的模擬能夠可重復(fù)出現(xiàn)，因為很多時候我們需要取隨機數(shù)，但這段代碼再...
