寫在前面 以前總看到問(wèn)題是，基因結(jié)構(gòu)可視化的問(wèn)題；現(xiàn)在則變成了啟動(dòng)子元件的預(yù)測(cè)或者說(shuō)可視化。這本身比較簡(jiǎn)單，也比較玄乎，所以我一直不是太樂(lè)意與別人討論。但學(xué)院今天斷網(wǎng)，手上的...
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植物啟動(dòng)子-順式作用元件-批量提取-預(yù)測(cè)-可視化分析 -
備戰(zhàn)半程馬拉松應(yīng)該注意哪些？作為跑步小白或者不經(jīng)常跑步的伙伴來(lái)說(shuō)，10公里以上的中長(zhǎng)跑就需要認(rèn)真對(duì)待，切不可盲目嘗試。 楊陵馬拉松還有兩周就要開(kāi)跑了，正好談一談我對(duì)備戰(zhàn)半程馬拉松的幾點(diǎn)經(jīng)驗(yàn)。 以下僅為個(gè)...
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? R語(yǔ)言安裝 (MAC)
因?yàn)镽語(yǔ)言在Data science領(lǐng)域也是個(gè)非常流行的編程語(yǔ)言，所以很多優(yōu)秀的教程、教材都是以R為例。雖然我喜歡Python，但是也不想放棄了那么多的優(yōu)秀教材。所以就小小的...
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終于，我也出了篇R語(yǔ)言入門手冊(cè)！1 什么是R語(yǔ)言R語(yǔ)言是一個(gè)開(kāi)源的數(shù)據(jù)分析環(huán)境，起初是由數(shù)位統(tǒng)計(jì)學(xué)家建立起來(lái)，以更好的進(jìn)行統(tǒng)計(jì)計(jì)算和繪圖，這篇wiki中包含了一些基本情況的介紹。由于R可以通過(guò)安裝擴(kuò)展包（P...
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植物基因組數(shù)據(jù)庫(kù)
| Database | URL | Species || RARTF | http://rarge.gsc.riken.jp/rartf/ | 擬南芥 || AGRIS, ...
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矯正基因結(jié)構(gòu)注釋 - 做有良心的基因家族分析寫在前面 半個(gè)月前，我推了一個(gè)《任何人都能掌握-基因家族分析》的騰訊課程（原本事實(shí)是開(kāi)給課題組）。在熱身課程（完全免費(fèi)）中，將我個(gè)人對(duì)基因家族分析的認(rèn)知和其意義均做了說(shuō)明，感...
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TBtools基因家族分析詳細(xì)教程(3)基因家族成員的進(jìn)化分析2基因-共線性的定義與常見(jiàn)算法原理 物種內(nèi)的共線性分析文件準(zhǔn)備（物種比對(duì)到自身的.blast文件，物種基因信息文件.gff文件），運(yùn)行MCScanX，輸出collinear和t...
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用tbtools進(jìn)行基因家族分析《一》此版本為無(wú)代碼版本，依賴tbtools來(lái)實(shí)現(xiàn)，純粹記錄自己的學(xué)習(xí)經(jīng)驗(yàn)。 蛋白序列的blast比對(duì) 選擇擬南芥基因家族的蛋白序列文件 選擇你想要查找的基因家族的基因組蛋白文件 ...
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TBtools基因家族分析詳細(xì)教程(2)基因家族成員的基本分析包括基因成員的序列特征分析（分子量等電點(diǎn)等）基于motif分析成員序列保守特征與可視化（蛋白與核酸，可用于挖掘未知，尤其是核酸水平-非編碼水平的保守）基于domain分析成員...
