前言： 這篇主要記一下如何使得本地的文件輸出到網(wǎng)頁(yè)上。（1）將通過(guò)flask_sqlalchemy把python和sql數(shù)據(jù)庫(kù)聯(lián)系起來(lái)，把你的文件上傳到數(shù)據(jù)庫(kù)上。（2）使用f...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：廣東
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Flask-sqlalchemy讀取文件到數(shù)據(jù)庫(kù)并輸出到網(wǎng)頁(yè)上 -
解決問(wèn)題‘~/anaconda3/etc/conda/deactivate.d/deactivate-gxx_linux-64.sh: Syntax error: "(" unexpected’
系統(tǒng)：Debian在shell中輸入sudo dpkg-reconfigure dash，在彈出的頁(yè)面中選擇'no'。
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雙端測(cè)序的mRNA-seq處理過(guò)程
1.從SRA數(shù)據(jù)庫(kù)選擇原始測(cè)序數(shù)據(jù)并下載【下載之前看一眼是single還是paired】 結(jié)果：在執(zhí)行命令的目錄下出現(xiàn)SRR1186241_1.fastq和SRR118624...
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TCGA-miRNA的生存分析引言：之前寫了mRNA的生存分析，對(duì)于miRNA來(lái)說(shuō)基本一致，只不過(guò)因?yàn)閺腡CGA上下載的miRNA的reads文件和mRNA有一點(diǎn)不一樣，需要額外處理一下。TCGA-mRN...
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karyoploteR畫enhancer附近的信號(hào)分布效果圖： 感覺(jué)就一個(gè)不好理解的參數(shù)：r0和r1r0：是起始的高度r1：是結(jié)束的高度r1-r0才是我們想要展示內(nèi)容的高度（想象這個(gè)畫布本身就有刻度線） 傳入的增強(qiáng)子文件格式：前...
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TCGA-mRNA的生存分析引言：本文主要記錄mRNA生存分析過(guò)程中遇到的問(wèn)題以及具體過(guò)程，生存分析用的是最常見(jiàn)的KM法Kaplan-Meier。 工具：TCGA的數(shù)據(jù)通過(guò)library(TCGAbio...
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不常上線，有事可以找@547的小書(shū)童呀
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用TCGAbiolinks從TCGA數(shù)據(jù)下載到下游分析的學(xué)習(xí)筆記
前言 之前一直在用RTCGA包下載數(shù)據(jù)，看著永不更新的數(shù)據(jù)，心里總覺(jué)得怪怪的，于是下定決心重新學(xué)習(xí)一個(gè)好用的包——TCGAbiolinks。這個(gè)包調(diào)用GDC的API，應(yīng)該是最...
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js中++i和i++的理解
關(guān)于++i和i++的理解 最常聽(tīng)說(shuō)的一句話就是：前置遞增：先遞增后賦值后置遞增：先賦值后遞增 再加上常用的寫法是a=i++這種，有的用運(yùn)算優(yōu)先級(jí)解釋的(很明顯也不成立)，就沒(méi)...
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Bowtie Error: Saw ASCII character 10 but expected 33-based Phred qual
關(guān)于這個(gè)問(wèn)題的解決方法：是解答說(shuō)因?yàn)橛虚L(zhǎng)度為0的測(cè)序數(shù)據(jù)。所以使用cutadapt 的-m參數(shù) 設(shè)置一個(gè)最短序列長(zhǎng)度，去掉太短的測(cè)序結(jié)果。 參考：https://github...
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對(duì)JavaScript的Event對(duì)象的理解
今天寫一下個(gè)人覺(jué)得在JS中比較重要又比較獨(dú)特的對(duì)象--Event對(duì)象以及應(yīng)用。 －簡(jiǎn)單介紹JS－ 談到j(luò)avascript，很多人(比如我)總想探究一下它和Java的關(guān)系，其...
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生物信息系列：根據(jù)成對(duì)bed文件以及多個(gè)BigWig文件畫出信號(hào)圖
引言：本期文章是記錄一下如何利用一對(duì)bed文件以及多個(gè)BigWig文件提取信號(hào)值并進(jìn)行畫圖的實(shí)現(xiàn)過(guò)程。 Materials：兩個(gè)bed文件，多個(gè)ENCODE數(shù)據(jù)庫(kù)下載的組蛋白...
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pandas用法歸納＋簡(jiǎn)單的文件處理命令
古人云：溫故而知新。最近把pandas的一些常用的方法以及一些處理文件的常用命令用法總結(jié)了一下，因?yàn)樵俨粡?fù)習(xí)就真忘了。 01 — pandas Q1:有時(shí)候列數(shù)很多，不可能手...
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HTML5之localStorage實(shí)現(xiàn)“是否保存密碼”
“ 最近學(xué)習(xí)了一下關(guān)于web應(yīng)用的本地儲(chǔ)存，一個(gè)簡(jiǎn)單的例子就是平時(shí)在登陸界面的“是否保存密碼”，所以主要列出實(shí)現(xiàn)的腳本以及學(xué)習(xí)中遇到的問(wèn)題” 背景： 本地存儲(chǔ)：包括web-S...
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HTML <label> 標(biāo)簽<label> 標(biāo)簽的作用 在HTML中 標(biāo)簽不會(huì)向用戶展示任何特殊內(nèi)容,它的作用是把自己與其他標(biāo)簽"綁定"起來(lái)，也可以說(shuō)是與其他元素關(guān)聯(lián)到一起，粗暴點(diǎn)說(shuō)就是 有一腿。 與其...
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HTML <label> 標(biāo)簽
<label> 標(biāo)簽的作用 在HTML中 標(biāo)簽不會(huì)向用戶展示任何特殊內(nèi)容,它的作用是把自己與其他標(biāo)簽"綁定"起來(lái)，也可以說(shuō)是與其他元素關(guān)聯(lián)到一起，粗暴點(diǎn)說(shuō)就是 有一腿。 與其...
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