CellPhoneDB作為出鏡率很高的細胞互作分析工具,也是大家公認的。網上有很多教程,按理說在自己單細胞系列也應該出一個教程,但是由于CellPhoneDB是基于pytho...
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細胞配受體通識以及常見細胞分泌信號通路[http://www.itdecent.cn/p/df4721d29a91]CellChat:細胞間相互作用分析利器[https:/...
1. 兩種基因功能富集方法介紹 名詞解釋:1. 基因功能富集分析:包括過表達分析ORA、功能分類打分FCS、基于同路拓撲結構PT和基于網絡拓撲結構NT和基因富集分析GSEA。...
簡介和前期文章 我對之前的所有教程進行了再次詳細的總結CRISPR-Cas9基因編輯之背景介紹及gRNA設計(上) 前言: 在上一次文章中,我們已經得到了在線工具設計的sgR...
果子老師做過一個非常驚人的舉動,用DESeq2處理1225例樣本的TCGA數據,在沒有使用DESeq多線程參數parallel的情況下,跑了將近40個小時。 那么問題來了,在...
ID轉換過程中會有基因丟失這件事情,在部分做干實驗的人看來,是非常正常的。但不做干實驗的濕實驗人知道這件事,心里可能會有疙瘩。為什么要丟失呢?為什么丟失了不補回來? 在分析結...
1.技術重復 同一個樣品測多次。例如給某伙計取血樣,測5次基因表達量 能得到的信息 1.這伙計精確的基因表達量2.基因表達量測量方法的準確程度(看多次測量的重復性好不好) 使...
前言 目前我的課題是植物方面的單細胞測序,所以打算選擇植物類的單細胞測序數據進行復現,目前選擇了王佳偉老師的《A Single-Cell RNA Sequencing Pro...