二.變異結(jié)果注釋與統(tǒng)計(jì) 書接上回http://www.itdecent.cn/p/ab6a35502786[http://www.itdecent.cn/p/ab6a35...
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二代群體遺傳與重測序（中） -
實(shí)驗(yàn)室抗生素母液配制
本文參考：分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)常用抗生素的配制[http://www.itdecent.cn/p/e510b7cfb164],在其基礎(chǔ)上補(bǔ)充了部分內(nèi)容。 1. 氨芐青霉素（Amp...
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RIdeogram：染色體數(shù)據(jù)可視化的R包已有的工具如circos, 只能繪制彎的染色體，又如R包c(diǎn)hromoMap，IdeoViz，karyploteR，ggbio和在線工具Idiographica，雖然能繪制直的...
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Mash: 使用MinHash快速估算基因距離
工具介紹 Mash擴(kuò)展了MinHash降維技術(shù)，使其成對的突變距離和P值顯著性檢驗(yàn)，從而可以有效地聚類和搜索大量序列集合?；齑顚⒋笮蛄泻托蛄屑€原為較小的代表性草圖，進(jìn)而可以...
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基因家族分析（3）進(jìn)化樹構(gòu)建及美化基因家族樹構(gòu)建最常用的方法是 NJ 法和 ML 方法，構(gòu)建進(jìn)化樹之前，需要進(jìn)行多序列比對。 多序列比對 多序列比對的作用是將核酸或者氨基酸序列對齊，使得相同殘基的位點(diǎn)位于同一...
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基因家族分析（5）繪制基因結(jié)構(gòu)圖本節(jié)介紹一款在線繪制基因結(jié)構(gòu)的工具Gene Structure Dispaly Server（GSDS），簡單好用功能強(qiáng)大。將基因家族成員 gff3 文件單獨(dú)提取出來，運(yùn)用它...
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全基因組復(fù)制 WGD |（一）簡介
01 什么是全基因組復(fù)制 多倍化（polyploidy）或全基因加倍/復(fù)制（whole genome duplication, WGD）事件是指基因組內(nèi)的所有序列都發(fā)生重復(fù)，...
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pacbio 的bam文件轉(zhuǎn)成fasta文件
使用軟件SMRTlink 9轉(zhuǎn)換。 PacBio官網(wǎng)下載SMRTlink 9， https://downloads.pacbcloud.com/public/software...
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「BioNano系列」如何"從頭組裝"出一個(gè)Bionano圖譜官方并沒有一個(gè)很詳細(xì)的文檔描述Bionano的從頭組裝流程的具體過程，所以我只能根據(jù)自己實(shí)際項(xiàng)目進(jìn)行介紹: AutoNoise + SplitBNX: 這一步會將bnx和參考...
