DESeq2文庫標(biāo)準(zhǔn)化 問題1：調(diào)整文庫大小的差異 樣本1的read是樣本2的一半,樣本2中每個(gè)基因的read是樣本1的兩倍。這種差異不是生物學(xué)造成的，而是測(cè)序深度造成的。R...
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12高通量測(cè)序-DESeq2文庫標(biāo)準(zhǔn)化 -
《極簡(jiǎn)統(tǒng)計(jì)學(xué)》-幫你快速入門統(tǒng)計(jì)學(xué)作為前數(shù)學(xué)專業(yè)畢業(yè)生，學(xué)過的概率統(tǒng)計(jì)知識(shí)已經(jīng)忘記得差不多了，對(duì)于統(tǒng)計(jì)學(xué)的概念能清楚記得的也只有方差，標(biāo)準(zhǔn)差和均值了。正態(tài)分布只記得了一個(gè)曲線圖了，其他性質(zhì)什么的都不記得了。更...
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單細(xì)胞實(shí)戰(zhàn)2: Seurat+SingleR--從矩陣到細(xì)胞類型注釋單細(xì)胞數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)分析Seurat流程： Seurat官網(wǎng)：https://satijalab.org/seurat/articles/get_started.html[http...
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HISAT2 Bowtie2 提取唯一比對(duì) unique mapping reads
把read比對(duì)到基因組之后，需要提取唯一比對(duì)來進(jìn)行下一步分析。 bowtie2和HISAT2 都沒有只輸出唯一比對(duì)的命令，所以需要對(duì)比對(duì)結(jié)果sam文件進(jìn)行提取，可以通過sam...
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pacbio 三代全長轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析流程Iso-seq基礎(chǔ)概念，轉(zhuǎn)載自https://blog.csdn.net/weixin_34384681/article/details/85937505[https://b...
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DNA鏈方向上的小疑惑
雖然是做生物信息的，但是經(jīng)常被一些基礎(chǔ)性概念所困擾……而我又是一個(gè)強(qiáng)迫癥，于是把這些亂七八糟的東西整理了一下，強(qiáng)行寫了一篇小文章。東西太雜，但是彼此相關(guān)，實(shí)在想不到什么合適的...
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Ribo-seq我的學(xué)習(xí)總貼
Ribo-seq分析綜述Ribo-seq分析Ribo-seq分析必看文獻(xiàn) | 知識(shí)（一）：15年玉米R(shí)ibo-seq分析必看文獻(xiàn) | 知識(shí)（二）：19年植物綜述之Polyso...
