發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：山東
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用這個(gè)代碼做出來(lái)文件有點(diǎn)小，而生信自學(xué)網(wǎng)中用的perl腳本大概175m左右，這個(gè)代碼跑出來(lái)90m左右。這是什么問(wèn)題呢，????
TCGA基因表達(dá)數(shù)據(jù)和生存數(shù)據(jù)合并
打開(kāi)臨床數(shù)據(jù)excel，分別自定義排序futime和fustat,futime中去掉生存天數(shù)為0和沒(méi)有的數(shù)據(jù)，fustat中去掉無(wú)生存狀態(tài)的數(shù)據(jù)（1為死亡，0為存活） 將上圖...
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可關(guān)注微信公眾號(hào)：醫(yī)學(xué)生物信息學(xué)<br>（筆記在公眾號(hào)上更新）
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為什么輸出的文件不全呀，還是有哪里不對(duì)
基因表達(dá)矩陣和生存時(shí)間的合并
通常來(lái)說(shuō)，GEO和TCGA的基因表達(dá)數(shù)據(jù)和臨床數(shù)據(jù)是分開(kāi)的，為了合并這兩個(gè)數(shù)據(jù)，這里使用R進(jìn)行操作。 基因表達(dá)數(shù)據(jù)如下： 生存數(shù)據(jù)如下： 在R中讀入上述兩個(gè)數(shù)據(jù)，然后使用代碼...
