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用這個代碼做出來文件有點小,而生信自學網中用的perl腳本大概175m左右,這個代碼跑出來90m左右。這是什么問題呢,????
TCGA基因表達數(shù)據和生存數(shù)據合并打開臨床數(shù)據excel,分別自定義排序futime和fustat,futime中去掉生存天數(shù)為0和沒有的數(shù)據,fustat中去掉無生存狀態(tài)的數(shù)據(1為死亡,0為存活) 將上圖...
為什么輸出的文件不全呀,還是有哪里不對
基因表達矩陣和生存時間的合并通常來說,GEO和TCGA的基因表達數(shù)據和臨床數(shù)據是分開的,為了合并這兩個數(shù)據,這里使用R進行操作。 基因表達數(shù)據如下: 生存數(shù)據如下: 在R中讀入上述兩個數(shù)據,然后使用代碼...