昨天忘記說了，能考公務(wù)員就考公務(wù)員！尤其是江浙滬或者是大灣區(qū)的。 對很多初學(xué)者來說，從CRF上的數(shù)據(jù)到SDTM標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)集，這一過程是怎樣的不是很清楚，今天我就來講講。 拿下面...
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從抽象的CRF到具體的SDTM數(shù)據(jù)集
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STEP6:WGCNA相關(guān)性分析因為樣本數(shù)量比較可觀，所以可以進(jìn)行WGCNA分析。這里是并不需要選取所有的基因來做WGCNA分析，挑選的標(biāo)準(zhǔn)可以是top變異程度大的基因集合，或者顯著差異表達(dá)的基因集合等等。...
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WGCNA學(xué)習(xí)：WGCNA分析原理本教程根據(jù)PlantTech的WGCNA課程編寫，課程還是不錯的，所以將該課程給大家分享一下。 WGCNA筆記第一彈 WGCNA分析原理 WGCNA應(yīng)用場景 WGCNA分析實...
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2021-08-19WGCNA確定目標(biāo)模塊后如何找模塊內(nèi)的hubgene
WGCNA 分析確定重要模塊之后，如何找模塊內(nèi)的hubgene？ 想找hubgene,必須先理解其概念：網(wǎng)絡(luò)中處于核心位置的點（基因）。在WGCNA中，由于進(jìn)行了無尺度化處理...
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蛋白質(zhì)組學(xué)知識背景及分析流程蛋白質(zhì)組知識背景 蛋白質(zhì)組(proteome)：由一個細(xì)胞、一個組織或一個機(jī)體的基因組所表達(dá)的全部相應(yīng)的蛋白質(zhì)，是一個整體的概念。 蛋白質(zhì)組學(xué)(proteomics)：以蛋白...
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WGCNA（6）：篩選 hub gene通過前期的分析，我們確定了感興趣的module，但是module中又含有幾十甚至上百的基因，下一步需要進(jìn)一步篩選hub gene。 WGCNA（3）：基因模塊與性狀關(guān)聯(lián)識別重...
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【6】蛋白質(zhì)組學(xué)鑒定定量軟件之MaxQuant1.簡介 2016年，德國馬普所的Cox和蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域巨擘Matthias Mann合作開發(fā)了MaxQuant軟件（MQ），并發(fā)表在nbt上，protocol也相應(yīng)發(fā)表在n...
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DIA技術(shù)及其軟件工具介紹前言 關(guān)于蛋白質(zhì)組學(xué)，你是不是已經(jīng)聽了太多公司的宣講，介紹了一大堆的技術(shù)名詞，反而越聽越懵懂，腦袋一團(tuán)亂麻？就和傳話游戲一樣，當(dāng)我們接收了多手信息以后，得到的信息就越不準(zhǔn)確。...
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非模式生物KEGG富集分析寫在前面 因為我研究的物種比較小眾，很多注釋不完全，R包AnnotationHub中也沒有對應(yīng)信息，所以無法使用公共數(shù)據(jù)庫進(jìn)行kegg富集分析。所以自己嘗試使用KAAS造一個...
