測(cè)序上游分析系列： mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組二代測(cè)序從raw reads到表達(dá)矩陣：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量測(cè)序pipeline：從raw r...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：湖南
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TCGA轉(zhuǎn)錄組差異分析后多種基因功能富集分析：從GO/KEGG到GSEA和GSVA/ssGSEA（含基因ID轉(zhuǎn)換） -
差異基因分析不會(huì)做？最簡(jiǎn)單的火山圖做法，一秒學(xué)會(huì)最近很多剛了解生信的同學(xué)問(wèn)喵學(xué)姐：看了一些文獻(xiàn)，文獻(xiàn)里的各種圖怎么看呀，完全看不懂。今天喵學(xué)姐就來(lái)給大家講一講我們平時(shí)做的最基礎(chǔ)的差異分析——火山圖 火山圖（Volcano ...
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NetworkAnalyst3.0：差異基因篩選，功能富集分析、基因網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建等功能于一體的在線基因表達(dá)分析工具
hello大家好，小月亮又和大家見(jiàn)面了。上篇軟文小月亮給大家介紹了NetworkAnalyst3.0工具的概覽。這次小月亮就給大家詳細(xì)介紹NetworkAnalyst3.0工...
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篩選差異基因，倍數(shù)法，t檢驗(yàn)，SAM一、 實(shí)驗(yàn)內(nèi)容利用SAM篩選差異基因比較篩選差異基因的方法：倍數(shù)法，t檢驗(yàn)，SAM二、 實(shí)驗(yàn)?zāi)康?掌握篩選差異基因的方法，為了探究倍數(shù)法，t檢驗(yàn)，SAM這三種篩選差異基因...
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轉(zhuǎn)錄因子靶基因互相預(yù)測(cè)全網(wǎng)最全，沒(méi)有之一
轉(zhuǎn)錄因子靶基因互相預(yù)測(cè)全網(wǎng)最全，沒(méi)有之一 還記得先前提到的基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控?cái)?shù)據(jù)庫(kù)“轉(zhuǎn)錄因子靶基因預(yù)測(cè)，不用到處搜了，都在這了[https://mp.weixin.qq.com/s...
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零基礎(chǔ) | 基于轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合 Motif 的基因間調(diào)控關(guān)系預(yù)測(cè)寫(xiě)在前面 很多時(shí)候，我們會(huì)得到一個(gè)基因集合： 通過(guò)GWAS定位到幾個(gè)區(qū)間，每個(gè)區(qū)間有一堆基因，合并起來(lái)是一個(gè)集合； 通過(guò)RNAseq轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析，差異表達(dá)基因，有一個(gè)集合；...
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在NCBI上上傳ITS序列打開(kāi)NCBI的submit頁(yè)面，點(diǎn)擊my submission按鈕，選擇Genbank。 點(diǎn)擊new submission submissionnal共有九步，分別為 ，在W...
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蛋白序列亞細(xì)胞定位工具評(píng)測(cè)
CELLO v.2.5: subCELlular LOcalization predictor 蛋白亞細(xì)胞定位訪問(wèn)網(wǎng)址：http://cello.life.nctu.edu....
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擬南芥轉(zhuǎn)化技巧Tips for arabidopsis transformation[https://blog.addgene.org/tips-for-arabidopsis-trans...
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遺傳轉(zhuǎn)化－葉盤(pán)法
遺傳轉(zhuǎn)化－葉盤(pán)法 預(yù)培養(yǎng)：選取5葉期本氏煙生長(zhǎng)較肥厚的葉片，用無(wú)菌水沖洗數(shù)遍后，用70 %乙醇表面消毒1min，25%的次氯酸鈉消毒2-3min，再用無(wú)菌水沖洗數(shù)遍，無(wú)菌濾紙...
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Graphpad繪制qpcr結(jié)果驗(yàn)證轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)圖當(dāng)通過(guò)qpcr驗(yàn)證基因表達(dá)是否與轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)一致，通常通過(guò)柱形圖與折線圖疊加的方式呈現(xiàn)，今天記錄下步驟。 軟件：Graphpad步驟1.輸入qpcr與轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)表達(dá)量，格式如下...
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從擬南芥的T0123代獲得純合株系，轉(zhuǎn)基因必經(jīng)之路！作為模式生物，擬南芥（Arabidopsisthaliana）主要有以下幾方面的優(yōu)勢(shì)： 第一，擬南芥的基因組在常見(jiàn)的植物模型中是最小的，染色體數(shù)目也很少，只有五對(duì)同源染色...
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MES的性質(zhì)及MES緩沖液配制
MES的性質(zhì)及MES緩沖液配制及保存 MES中文名稱： 2-（N-嗎啉代）乙磺酸分子式： C6H13NO4S分子量： 195.2 g/mol英文名稱：4-Morpholine...
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煙草瞬時(shí)表達(dá)（亞細(xì)胞定位/BiFC）參考方法：https://www.bio-protocol.org/bio101/e1010133[https://www.bio-protocol.org/bio101/e...
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WGCNA
WGCNA分析，簡(jiǎn)單全面的最新教程
本文應(yīng)該是第二全的WGCNA分析教程，參考了最新的文檔。第一全的還在路上，會(huì)出現(xiàn)于生信寶典和宏基因組公眾號(hào)組織的二代三代轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析實(shí)戰(zhàn)班上，歡迎點(diǎn)擊鏈接了解更多。 WGC...
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