腸道菌群,血清/血漿代謝組 貌似幾乎可以跟一切疾病一切機(jī)體狀態(tài)進(jìn)行關(guān)聯(lián),包括本研究的妊娠期糖尿病。孕期糖尿病顯然會(huì)更復(fù)雜,可能改變正常孕期,影響胎兒。 那么妊娠期糖尿病的生理...
腸道菌群,血清/血漿代謝組 貌似幾乎可以跟一切疾病一切機(jī)體狀態(tài)進(jìn)行關(guān)聯(lián),包括本研究的妊娠期糖尿病。孕期糖尿病顯然會(huì)更復(fù)雜,可能改變正常孕期,影響胎兒。 那么妊娠期糖尿病的生理...
們看看脂肪代謝組學(xué)和mRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析,文章的謀篇布局。 文獻(xiàn)題目:脂質(zhì)組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)鑒定德州驢肌內(nèi)脂肪和內(nèi)臟脂肪組織的異質(zhì)性 背景:瘦肉里有脂肪,內(nèi)臟有脂肪,為什么瘦肉里...
塑料是常見污染物,都說對(duì)人類是有危害的,影響到底有多大呢?使用肝細(xì)胞,肺細(xì)胞作為模型,從代謝組學(xué)的角度探討可能的表型改變。 文獻(xiàn)題目:代謝組學(xué)揭示納米顆粒誘導(dǎo)的人肝和肺細(xì)胞線...
背景:前人分開測(cè)過很多次肺纖維化組織的轉(zhuǎn)錄組,蛋白組,也一起測(cè)過,我們還是得測(cè)一次,畢竟別人有數(shù)據(jù),數(shù)據(jù)也不是我的。我這邊測(cè)一測(cè),手里有差異分子表,也好開展后續(xù)的機(jī)制研究。 ...
做了多個(gè)組學(xué)的數(shù)據(jù),該怎么分析呢? 本文章題目:單細(xì)胞RNA測(cè)序輔助多組學(xué)分析發(fā)現(xiàn)肝內(nèi)膽管癌分子亞群 數(shù)據(jù):(1)110個(gè)(分析)+ 41個(gè)(驗(yàn)證集)患者的ICC組織蛋白組學(xué)...
上一篇我們看了臨床組織標(biāo)本轉(zhuǎn)錄組與蛋白組一起分析,如果研究某個(gè)基因,對(duì)其進(jìn)行敲除后同時(shí)做轉(zhuǎn)錄組蛋白組一般會(huì)做哪些分析,得到哪些結(jié)果,如何展示圖及討論呢? 本文題目:南美白對(duì)蝦...
背景說明: 腫瘤不只原發(fā)灶與癌旁,還有很多其他位置的病理組織,比如淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移,以及周圍腫瘤細(xì)胞的聚集體(非原發(fā)灶)。腫瘤細(xì)胞聚集體的重要性比不上原發(fā)灶,但也應(yīng)該要考慮研究的。...
@墨墨_eea8 前邊是對(duì)照,后邊是處理。
edgeR差異基因分析的一般過程基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序獲得的定量表達(dá)值,識(shí)別差異表達(dá)變化的基因或其它非編碼RNA分子,實(shí)際上方法還是非常多的。但就目前來看,DESeq2和edgeR是出現(xiàn)頻率最高的兩種方法了。 DE...
本期我們一起了解一下,m6A測(cè)序描述性文章的寫作思路 以下是視頻錄屏鏈接,有需要的老師可以觀看。 B站超清鏈接: 上:https://www.bilibili.com/vid...
我們?cè)诰W(wǎng)上看到某些公眾號(hào)在鋪天蓋地的推“生信文章”,號(hào)稱點(diǎn)點(diǎn)鼠標(biāo),5分鐘出來一篇三分SCI的數(shù)據(jù)。有的機(jī)構(gòu),甚至給出了每個(gè)圖的腳本,一步步出圖,換一種腫瘤就是一篇文章。囂張程...
上期我們回顧了幾種m6A基本機(jī)制,有講解了m6A機(jī)制的核心機(jī)理,今天我們?cè)诖嘶A(chǔ)上討論一下,lncRNA/circRNA與m6A機(jī)制關(guān)聯(lián)的幾種思路。 以下是視頻錄屏鏈接,有需...
m6A 是目前研究的熱點(diǎn),最近出來的高分文章很多。相當(dāng)多的老師是在研究m6A對(duì)靶標(biāo)RNA的調(diào)控機(jī)制。我們?cè)?020年底討論過3類m6A的經(jīng)典思路。 1. 從甲基酶/去甲基酶入...
lncRNA機(jī)制研究從樣本的準(zhǔn)備提取、到結(jié)論的猜想驗(yàn)證等等,通常會(huì)做各種各樣的實(shí)驗(yàn),本期我們就跟大家一起來解一下在lncRNA機(jī)制研究中部分常見的實(shí)驗(yàn)。 以下是視頻錄屏鏈接 ...
lncRNA機(jī)制研究最常見的機(jī)制是通過結(jié)合某蛋白,調(diào)控該蛋白的功能。當(dāng)我們打算做這方面的研究時(shí),需要考慮結(jié)合蛋白,通常會(huì)有什么樣的改變呢?表達(dá)量變化?功能的改變?怎么分析?我...
在lncRNA機(jī)制研究里,有一小眾人群在做SNP調(diào)控lncRNA表達(dá),或功能改變的機(jī)制研究,不少CNS文章。SNP是突變位點(diǎn),已報(bào)道許多重要的SNP與疾病密切關(guān)聯(lián)。那么這些S...
在lncRNA機(jī)制研究里,有一小眾人群在做SNP調(diào)控lncRNA表達(dá),或功能改變的機(jī)制研究,不少CNS文章。SNP是突變位點(diǎn),已報(bào)道許多重要的SNP與疾病密切關(guān)聯(lián)。那么這些S...
lncRNA是個(gè)神奇的分子,被研究了很多年,可依然還有大量的高分文章發(fā)表。小編收集了2020.06以來的lncRNA文獻(xiàn),發(fā)現(xiàn)超過10分的機(jī)制文章不下百篇。可以看出,做lnc...
Artificial Cells Nanomedicine and Biotechnology是一門跨學(xué)科期刊,在人工細(xì)胞、納米醫(yī)學(xué)和健康相關(guān)生物技術(shù)的融合中發(fā)表了高質(zhì)量的開...
circRNA的研究很火熱,不過思路大體就那么三四種,ceRNA機(jī)制,結(jié)合蛋白,翻譯多肽,m6A甲基化調(diào)控。很多老師希望做出新意。 我們平時(shí)看文獻(xiàn)可能看到過,研究腫瘤中的病毒...