我發(fā)現(xiàn)2020年了，pysam還是不能在windows平臺(tái)下載，難受
用python做生物信息數(shù)據(jù)分析（2-pysam）寫perl的思維，可能確實(shí)不能拿來(lái)學(xué)python。畢竟，python的褲子有很多。面向?qū)ο蟮恼Z(yǔ)言，如果不好好穿褲子，怎么找對(duì)象？。手上要做的事情，需要解析sam，更或者bam...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：香港
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我安裝了pysam-win，但是沒(méi)有用啊，我還是用不了pysam?。?
用python做生物信息數(shù)據(jù)分析（2-pysam）
寫perl的思維，可能確實(shí)不能拿來(lái)學(xué)python。畢竟，python的褲子有很多。面向?qū)ο蟮恼Z(yǔ)言，如果不好好穿褲子，怎么找對(duì)象？。手上要做的事情，需要解析sam，更或者bam...
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python中的編碼與解碼python2和python3中重大的不同是string的類型不同，在python2中，string其實(shí)是對(duì)應(yīng)于字節(jié)流，而在python3中則直接對(duì)應(yīng)于unicode字符集，...
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變異位點(diǎn)的歸一化(normalization of indel)
一、定義二、indel的左對(duì)齊三、多等位位點(diǎn)的左對(duì)齊 定義 在二代測(cè)序中，使用bcftools call或者 gatk HaplotypeCaller工具檢出變異位點(diǎn)的時(shí)候，...
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seqkit的安裝與使用安裝： conda install seqkit ref:seqkit一個(gè)FASTA/Q序列處理神器 - 遺世獨(dú)立的愚公 - 博客園 一、序列操作： 1.取反向序列 seqk...
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啦啦啦，每天睡到自然醒吧
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公眾號(hào): 醫(yī)科研<br>wechat: YKY7060
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周運(yùn)來(lái)，男，長(zhǎng)大了才會(huì)遇到的帥哥，穩(wěn)健，瀟灑，大方，靠譜。一段生信緣，一棵技能樹(shù)。生信技能樹(shù)核心成員，單細(xì)胞天地供稿人，簡(jiǎn)書(shū)創(chuàng)作者，單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)家。
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負(fù)基礎(chǔ)學(xué)生信，歡迎互相交流
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GATK4 多個(gè)樣本GenotypeGVCFs前用 CombineGVCFs還是GenomicsDBImport
我們知道，GATK 4 多個(gè)樣本joint genotyping用模塊GenotypeGVCFs, 目前GenotypeGVCFs只支持以下三種形式的輸入文件：1）a sin...
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計(jì)算生物學(xué)、統(tǒng)計(jì)學(xué)、機(jī)器學(xué)習(xí)<br>
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公眾號(hào)：TOP生物信息<br>B站：TOP菌<br>WeChat：TOPJUN996<br><br>top2讀研，學(xué)習(xí)方向：癌癥基因組、腫瘤免疫、單細(xì)胞組學(xué)
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我的全部道路<br>就是從孤獨(dú)走向人間<br>
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Python __all__ 用法
在讀 Django 源碼時(shí)發(fā)現(xiàn)了這個(gè) __all__：https://github.com/django/django/blob/master/django/http/__i...
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充電ing...
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Python __iter__ 深入理解
先看一個(gè)例子： 通過(guò)這個(gè)斐波那契數(shù)列生成器來(lái)理解 __iter__。定義 __iter__ 表示這個(gè)類是一個(gè)迭代器（iterator）。它只在迭代開(kāi)始的時(shí)候運(yùn)行一次。返回的是...
