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  • miniconda的常用命令匯總

    寫這個(gè)的目的主要是年紀(jì)大了,老是記不住命令行,索性整理下來(lái),忘了就不用滿世界找了。 和channels有關(guān)的命令 查看已經(jīng)添加的channels...

  • Linux下miniconda的安裝使用

    Anaconda與Miniconda的區(qū)別 Anaconda是一個(gè)打包的集合器皿,里面預(yù)裝好了conda、某個(gè)版本的python、眾多packa...

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    如何區(qū)分基因的顯性效應(yīng)(Dominance effect)和上位性效應(yīng)(Epistatic effect)

    基因的上位性效應(yīng)和顯性效應(yīng)聽名字就覺(jué)得挺繞的,聽起來(lái)就是一個(gè)基因?qū)α硪粋€(gè)基因的壓制效果,網(wǎng)上的介紹看起來(lái)云里霧里,還搬來(lái)染色體,標(biāo)記的性狀,感覺(jué)...

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    建立者效應(yīng)(founder effect)和瓶頸效應(yīng)(bottleneck effect)

    我對(duì)種群遺傳學(xué)這塊一直不太熟悉,奈何實(shí)驗(yàn)室中經(jīng)常有需要涉及到種群進(jìn)化這塊的內(nèi)容,所以以下的這塊介紹,大抵將給我自己聽的。 建立者效應(yīng) 建立者效應(yīng)...

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    基因的可變剪切(alternative splicing)和蛋白異構(gòu)體(Protein isoform)

    寫這個(gè)文章的原因是因?yàn)槲以谟肨rinity組裝轉(zhuǎn)錄組的時(shí)候,除去軟件的原因,在生物體內(nèi)有很多的可變剪切現(xiàn)象,定義就是一個(gè)mRNA前提可以通過(guò)不同...

  • 如何用fasq-dump解壓SRA文件

    之前介紹了如何安裝sratoolkit, 可以看我之前寫的簡(jiǎn)書http://www.itdecent.cn/p/188df05615c7[ht...

  • fastq格式,如何快速計(jì)算fasta, fastq的reads數(shù)?

    FASTQ fastq格式是一種基于文本的存儲(chǔ)生物序列和對(duì)應(yīng)堿基或者氨基酸質(zhì)量的文件格式,最初由桑格研究所(Wellcome Trust San...

  • 線粒體組裝軟件(2) NOVOPlasty

    NOVOPlasty是一個(gè)小型環(huán)狀基因組的軟件,這意味著這個(gè)軟件可以組裝線粒體基因組和葉綠體基因組。這個(gè)軟件是一個(gè)perl的腳本,直接就可以運(yùn)行...

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    如何區(qū)分直系同源(Orthologs)和旁系同源(Paralogs)?

    做進(jìn)化的總是免不了區(qū)分直系同源和旁系同源,還有一個(gè)同源基因,我剛接觸進(jìn)化的時(shí)候經(jīng)常搞不懂這三貨,好在我老板不嫌我笨,兩遍三遍超有耐心的教,有老板...

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主業(yè)是優(yōu)秀的峽谷召喚師,副業(yè)是敲敲代碼
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