1：在線構(gòu)建RAxML樹 1. CIPRES網(wǎng)站： CIPRES Science Gateway V3.3[http://www.phylo.org/index.php/po...
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在線和本地兩種方法構(gòu)建 RAxML 進化樹方法和解讀 -
【ProteoWizard MSConvert】質(zhì)譜文件格式簡介及其轉(zhuǎn)換質(zhì)譜格式 質(zhì)譜文件格式多種多樣，各儀器廠商產(chǎn)出的數(shù)據(jù)都有不同。雖然HUPO已經(jīng)對質(zhì)譜數(shù)據(jù)進行了標(biāo)準(zhǔn)化，但大家依然是我行我素，因為不得不用它們提供的軟件，而不同的軟件會要求不同...
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使用EGGNOG-Mapper對非模式物種快速進行GO或KEGG注釋對于非模式物種，需要做GO或KEGG富集，可以嘗試使用EGGNOG-Mapper來對你的物種序列進行快速注釋。在注釋結(jié)果文件中，可以同時獲得序列映射上的GO號或KO號，直接提...
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Linux下miniconda的安裝使用
Anaconda與Miniconda的區(qū)別 Anaconda是一個打包的集合器皿，里面預(yù)裝好了conda、某個版本的python、眾多packages、科學(xué)計算工具等等，所以...
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miniconda的常用命令匯總
寫這個的目的主要是年紀(jì)大了，老是記不住命令行，索性整理下來，忘了就不用滿世界找了。 和channels有關(guān)的命令 查看已經(jīng)添加的channels 增加channels 有時候...
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基因的可變剪切(alternative splicing)和蛋白異構(gòu)體(Protein isoform)寫這個文章的原因是因為我在用Trinity組裝轉(zhuǎn)錄組的時候，除去軟件的原因，在生物體內(nèi)有很多的可變剪切現(xiàn)象，定義就是一個mRNA前提可以通過不同的內(nèi)含子出去方式獲得成熟的mR...
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如何區(qū)分基因的顯性效應(yīng)(Dominance effect)和上位性效應(yīng)(Epistatic effect)基因的上位性效應(yīng)和顯性效應(yīng)聽名字就覺得挺繞的，聽起來就是一個基因?qū)α硪粋€基因的壓制效果，網(wǎng)上的介紹看起來云里霧里，還搬來染色體，標(biāo)記的性狀，感覺更加復(fù)雜了。 基因的顯性效應(yīng) ...
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建立者效應(yīng)(founder effect)和瓶頸效應(yīng)(bottleneck effect)我對種群遺傳學(xué)這塊一直不太熟悉，奈何實驗室中經(jīng)常有需要涉及到種群進化這塊的內(nèi)容，所以以下的這塊介紹，大抵將給我自己聽的。 建立者效應(yīng) 建立者效應(yīng)是指少數(shù)個體的基因頻率決定了他...
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如何用fasq-dump解壓SRA文件
之前介紹了如何安裝sratoolkit, 可以看我之前寫的簡書http://www.itdecent.cn/p/188df05615c7[https://www.jians...
