你的代碼不對哎
R語言 向dataframe中添加一行或一列如何向R中的dataframe的某一位置添加一行（rbind函數）或一列向量（cbind函數） 插入一列 插入一行
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單細胞測序（scRNA-seq）通關||數據處理必知必會單細胞轉錄組數據分析系列教程 sc-RAN-seq 數據分析||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial[https://www.jians...
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bedtools----getfasta
getfasta可以根據BED/GFF/VCF文件提供的feature在染色體上的位置信息，從fasta中提取feature的堿基序列 bedtools getfasta [...
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RNA-seq的標準化方法羅列
RNA-seq的標準化方法 對于RNA-seq而言，由于 技術誤差， 測序深度不同， 基因長度不同，為了能夠比較不同的樣本，比較不同的基因的表達量，以及使表達水品分布符合統(tǒng)計...
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TCGA下載RNA-seq數據的區(qū)別
現UCSC xena已經將TCGA數據匯總整理得很好了，連表達矩陣都已轉換完成。但如果有心就會發(fā)現，UCSC上的RNAseq數據有3個下載鏈接，以下將以cohort: TCG...
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利用R包TCGAbiolinks進行各種數據下載下載TCGA數據的方法有很多，上一篇介紹了如何用gdc-client批量下載數據，基于網上有很多用TCGAbiolinks包下載數據的教程，所以也想學習一下這個方法。TCGA...
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linux mint安裝最新R與R studio背景 之前將一臺老電腦重裝系統(tǒng)為linux mint的，也是為了學好linux 操作創(chuàng)造環(huán)境。 安裝R的時候，之前的想法就是conda托管R，所以直接創(chuàng)建了R的環(huán)境，并安裝了...
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R語言機器學習-caret介紹 caret包（Classification and Regression Training）是一系列函數的集合，它試圖對創(chuàng)建預測模型的過程進行流程化。本系列將就數據預處...
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Cytoscape插件2：CytoHubbaCytoHubba:發(fā)現復雜網絡的關鍵目標和子網絡網絡對呈現包括PPI，基因調控，細胞路徑和信號轉導等多種類型生物數據非常有用。我們//+重要性，并且這也能幫助我們發(fā)現網絡中...
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了解下載的TCGA數據的臨床情況
TCGA數據庫不僅僅存儲了測序數據，更為珍貴的是TCGA數據庫也存儲了相關的臨床信息，有了這些臨床信息，后續(xù)可以進行多種分析，可以進行某個基因和臨床預后的相關性分析，根據臨床...
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生信技能樹線上課程：RNA-seq寫在前面 很榮幸參加生信技能樹全國巡講-第一站-重慶站的RNA-seq線下培訓課程。以下為線下課結合線上課所做的筆記，希望能幫到你。 一些小練習題 下面開始RNA-seq流程...
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免疫細胞組分 免疫基因 PD1 免疫治療biomarker
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【CIBERSORT】超詳細，從數據下載到數據分析（初學者筆記）【CIBERSORT】超詳細，從數據下載到數據分析全過程(初學者筆記) cibersort是目前引用次數最多的免疫細胞浸潤估計分析工具，2015年首次發(fā)表于nature me...
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復現詳解：純R代碼實現ssGSEA算法評估腫瘤免疫浸潤程度一 . 從GEO數據庫中下載表達矩陣文件 GSE112996_merged_fpkm_table.txtGSE112996_series_matrix.txt，把GSE112...
