前言 ??最近在學(xué)習(xí)單細(xì)胞方面的知識(shí)，遇到了一個(gè)小的需求就是截取需要的fastq序列。先來(lái)說(shuō)一下為什么有這個(gè)需求，一般來(lái)說(shuō)單細(xì)胞的測(cè)序文件有三個(gè)如test_R1.fastq....
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：湖北
-
python腳本截取fastq序列
-
R 語(yǔ)言計(jì)算生態(tài)位指數(shù)生態(tài)位寬度(Bi)采用Colwell等（1971）加權(quán)修正的Levins指數(shù) 式中，Bi為物種i的生態(tài)位寬度值，其范圍在[0-1]之間，值越大說(shuō)明該物種生態(tài)位寬度越寬；Pij...
-
跟著Nature學(xué)數(shù)據(jù)分析：R語(yǔ)言iNEXT包估計(jì)物種數(shù)并使用ggplot2作圖展示結(jié)果論文 Environmental factors shaping the gut microbiome in a Dutch population https://www.n...
-
微生物共現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)——Gephi繪圖網(wǎng)絡(luò)圖 共現(xiàn)網(wǎng)絡(luò)是研究突出了不同環(huán)境下微生物群落間的相互作用模式重要方式，可以從網(wǎng)絡(luò)角度理解微生物群落共現(xiàn)特征，包括分析不同生境下微生物之間相互作用的差異，及各個(gè)類(lèi)群之間的互...
