SMC++ 是分析種群歷史的一個(gè)軟件，主要用在重測(cè)序數(shù)據(jù)分析中。 git地址 GitHub - popgenmethods/smcpp: SMC++ infers popul...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：北京
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SMC++ 安裝 -
fastq污染源檢測(cè)參考： 生信：2：sam格式文件解讀[https://blog.csdn.net/genome_denovo/article/details/78712972]FastQ S...
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基因組重測(cè)序分析干貨### 一般從測(cè)序公司拿到的下級(jí)數(shù)據(jù)有raw data，或者經(jīng)過(guò)質(zhì)控之后的clean data，格式為fq。參考基因組及注釋文件gff從網(wǎng)上下載。分析流程如尾圖所示。 分析軟...
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二代測(cè)序序列拼接：fastp
對(duì)于PE數(shù)據(jù)，fastp通過(guò)-m/--merge選項(xiàng)實(shí)現(xiàn)拼接模式。-m, --mergefor paired-end input, merge each pair of re...
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序列比對(duì)軟件 MUMmer 結(jié)果文件解讀（三）該系列主要介紹了 MUMmer 軟件下核苷酸序列比對(duì)程序 nucmer 的使用，計(jì)算操作見(jiàn)前兩篇推文； 序列比對(duì)軟件 MUMmer 快速上手（一）[https://www.j...
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使用MAKER進(jìn)行注釋: 學(xué)習(xí)MAKER的配置參數(shù)
MAKER配置文件詳解 本文翻譯自http://weatherby.genetics.utah.edu/MAKER/wiki/index.php/The_MAKER_cont...
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samtools: sortsamtools sort [options] input.bam 僅可對(duì)bam文件進(jìn)行排序默認(rèn)對(duì)最左側(cè)坐標(biāo)進(jìn)行排序處理后會(huì)在header中加入相應(yīng)的行默認(rèn)輸出格式是bam，...
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NCBI下載SRA數(shù)據(jù)的4種方法??作為生命科學(xué)的從事者，不論是老師或者學(xué)生都應(yīng)該用過(guò)NCBI((National Center for Biotechnology Information Search d...
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無(wú)偏估計(jì)今天學(xué)習(xí)到一個(gè)名詞，無(wú)偏估計(jì)。如何理解“不論總體服從什么分布，樣本均值是總體均值的無(wú)偏估計(jì)量”這句話，什么是無(wú)偏估計(jì)呢？ 均值的無(wú)偏估計(jì) 比如我們想知道一個(gè)群體的平均身高，但...
