一、原理 Gene Ontology(GO)是一個國際標準化的基因功能分類體系,提供了一套動態(tài)更新的標準詞匯表,用于全面描述生物體中基因和基因產(chǎn)物的屬性。 1)GO包含三個主...
Coverage Depth 覆蓋深度 mapping depth 基因組被測序片段(短讀 short reads)“覆蓋”的強度有多大? 每一堿基的覆蓋率是基因組堿基被測序...
隨著基因組測序技術(shù)的不斷發(fā)展,越來越多的物種已完成全基因組密碼的破譯,在基因組信息全面解析的基礎(chǔ)上,對于某物種的功能基因定位,馴化等相關(guān)深入研究具有重要意義。然而在漫長的物種...
寫在前面 基因組組裝完成后,我們需要對我們組裝好的基因組進行一個質(zhì)量評估,質(zhì)量評估主要從連續(xù)性(continuity),完整性(completeness),準確性( accu...
這里有一份群體的學(xué)習課程,這篇推送主要基于這個作為參考,群體課程[http://www.uwyo.edu/dbmcd/popecol/index.html]Fst值[http...
寫在前面:當學(xué)習某一重要文件格式時,更需要對此格式對應(yīng)軟件工具進行全面的學(xué)習(如sam/bam——samtools)。在多次花時間寫腳本處理文件之后發(fā)現(xiàn),80%左右的任務(wù)其實...
ABBA-BABA分析方法最早發(fā)布于2012年NATURE的文章:Butterfly genome reveals promiscuous exchange of mimic...
最近的一次組會上看到實驗室的同學(xué)匯報的結(jié)果里有Hi-C的圖,所以我就悄咪咪的去了解了一下Hi-C技術(shù)的原理。整理一下。 Q1: Hi-C的全稱是什么? A: 高通量染色體構(gòu)象...