提取特定長(zhǎng)度的reads，初始版本，只適合小文件，25000條reads需要十幾分鐘：
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：湖北
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Python：從fastq.gz文件中提取特定長(zhǎng)度的reads，生成fastq（一）
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如何理解GWAS中Manhattan plot和QQ plot所傳遞的信息在GWAS研究中，Manhattan plot和QQ plot是最常畫的兩類圖，它們可以把跟研究的性狀（比如，基因型和身高）顯著相關(guān)的基因位點(diǎn)清晰地展現(xiàn)出來(lái)，不少讀者朋友應(yīng)該...
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GWAS理論 1-1 全基因組關(guān)聯(lián)分析基本概念和材料選擇先把GWAS系列課程看一遍，后面再把不懂的東西再補(bǔ)充上來(lái) 一、概念和理論基礎(chǔ) 全基因組關(guān)聯(lián)分析定義 是對(duì)多個(gè)個(gè)體在全基因組范圍的遺傳變異（標(biāo)記）多態(tài)性進(jìn)行檢測(cè)，獲得基因型，進(jìn)...
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利用plink對(duì)snp質(zhì)控的指標(biāo)和基本流程
在拿到一組snp數(shù)據(jù)時(shí)，首先應(yīng)該想到要對(duì)snp數(shù)據(jù)的質(zhì)量進(jìn)行檢測(cè)和控制。然后再考慮這組數(shù)據(jù)該怎么分析，如何分析。snp的質(zhì)控是非常重要的，如果snp數(shù)據(jù)的質(zhì)量不佳，那么計(jì)算的...
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GWAS學(xué)習(xí)筆記（2）-GWAS分析具體流程y一、認(rèn)識(shí)文件名 五大格式文件：ped&mapbed&fam&bim 各自存儲(chǔ)何種數(shù)據(jù) 五種格式 ①ped（pedigree，家系）：包含樣本的譜系信息和基因型信息，必須與f...
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生物數(shù)據(jù)庫(kù)部分合集
轉(zhuǎn)載自-----http://www.itdecent.cn/p/963343b5e135 核酸數(shù)據(jù)庫(kù) NCBI [https://www.ncbi.nlm.nih.gov...
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二級(jí)蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)Pfam 數(shù)據(jù)庫(kù) http://pfam.xfam.org/是一個(gè)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域家族的集合。蛋白質(zhì)一般由一個(gè)或多個(gè)功能區(qū)域組成，這些功能區(qū)域通常被稱為結(jié)構(gòu)域（domain）。在...
