公眾號(hào): 醫(yī)科研<br>wechat: YKY7060
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@626_71f4 影響應(yīng)該不大，但表達(dá)譜矩陣一般用的是gene symbol，不好意思第二個(gè)問(wèn)題沒(méi)太看懂
差異分析R語(yǔ)言實(shí)現(xiàn)
這次我來(lái)詳細(xì)的講講數(shù)據(jù)預(yù)處理，數(shù)據(jù)預(yù)處理這個(gè)過(guò)程呢，按我的理解就是先把高通量熒光信號(hào)轉(zhuǎn)化成基因表達(dá)數(shù)據(jù)，然后把各種各樣的的數(shù)據(jù)(有缺失值，有異常值，有值很小的，表達(dá)水平為負(fù)的...
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@626_71f4 是的
差異分析R語(yǔ)言實(shí)現(xiàn)
這次我來(lái)詳細(xì)的講講數(shù)據(jù)預(yù)處理，數(shù)據(jù)預(yù)處理這個(gè)過(guò)程呢，按我的理解就是先把高通量熒光信號(hào)轉(zhuǎn)化成基因表達(dá)數(shù)據(jù)，然后把各種各樣的的數(shù)據(jù)(有缺失值，有異常值，有值很小的，表達(dá)水平為負(fù)的...
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一一對(duì)應(yīng)的geneid，unique1對(duì)應(yīng)的
甲基化數(shù)據(jù)預(yù)處理（R語(yǔ)言）
一. 實(shí)驗(yàn)?zāi)康?學(xué)習(xí)如何下載甲基化數(shù)據(jù)及如何獲得每個(gè)探針的甲基化水平（beta值）。 二. 實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)及步驟 數(shù)據(jù)：來(lái)自GEO GSE27284_non-norm...
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公號(hào)“生物育種數(shù)據(jù)分析”作者，歡迎關(guān)注！日常分析生物數(shù)據(jù)分析筆記、經(jīng)驗(yàn)和小技巧。
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你看看mu_exp的數(shù)據(jù)類型，一般要矩陣
共突變通路識(shí)別（R語(yǔ)言實(shí)現(xiàn)）
寫(xiě)在前面：我認(rèn)為此次的任務(wù)重點(diǎn)在理清楚實(shí)驗(yàn)原理和步驟，代碼部分比較基礎(chǔ)也可用來(lái)研究共突變基因 一．實(shí)驗(yàn)內(nèi)容 共突變通路識(shí)別具體原理步驟如下 二．實(shí)驗(yàn)?zāi)康?（1）掌握通路富集方...
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MEGA構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)如何用MEGA-X構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)_生物研究_實(shí)用技巧_科研星球 (51xxziyuan.com)[https://www.51xxziyuan.com/54/1152.html]...
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篩選差異基因，倍數(shù)法，t檢驗(yàn)，SAM一、 實(shí)驗(yàn)內(nèi)容利用SAM篩選差異基因比較篩選差異基因的方法：倍數(shù)法，t檢驗(yàn)，SAM二、 實(shí)驗(yàn)?zāi)康?掌握篩選差異基因的方法，為了探究倍數(shù)法，t檢驗(yàn)，SAM這三種篩選差異基因...
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利用MATLAB實(shí)現(xiàn)FDR校正
芯片差異分析就是 對(duì)每個(gè)基因做t-test為什么要進(jìn)行FDR校正多重檢驗(yàn)問(wèn)題:同時(shí)識(shí)別兩個(gè)總體的成千上萬(wàn)個(gè)基因中哪些基因的表達(dá)水平有顯著性差異，錯(cuò)誤的概率在增加設(shè)定假設(shè)檢驗(yàn)水...
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多重比較-Bonferroni法和Benjamini & Hochberg法本次筆記主要介紹多重比較下兩種常用的矯正P值的方法：Bonferroni法和Benjamini & Hochberg法（BH法） 多重比較問(wèn)題 假設(shè)檢驗(yàn)的基本原理是小概率原理...
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2022《Cell》 作物馴化與育種中的整合基因組學(xué)導(dǎo)讀 野生植物被成功地馴化為農(nóng)作物是人類文明的大事件。該過(guò)程的成功很大程度上要?dú)w功于持續(xù)的人工選擇。本文總結(jié)了過(guò)去十年在作物馴化和育種研究中的新發(fā)現(xiàn)。作物基因組圖譜的構(gòu)建和眾...
個(gè)人介紹
本科學(xué)生物信息學(xué)，研究生轉(zhuǎn)成植物轉(zhuǎn)錄因子研究，依舊熱愛(ài)生物信息，希望可以和各位生信小伙伴交流學(xué)習(xí)。