最近從SRA下載的好幾個(gè)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的原始數(shù)據(jù)后綴名都是sralite.1，不管是windows還是Linux下，用sratoolkit轉(zhuǎn)化格式的過(guò)程中會(huì)導(dǎo)致出錯(cuò)，提示：“co...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：四川
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sralite.1文件的拆分
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這個(gè)世界流行離開(kāi)，但我們卻不擅長(zhǎng)告別
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Seurat官方教程|CITE-seq, RNA + ADT的WNN分析Compiled: March 18, 2021 原文鏈接：https://satijalab.org/seurat/articles/weighted_nearest_ne...
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R 報(bào)錯(cuò)：ERROR: failed to lock directory XXX 00LOCK
Error: install.packages failed to lock directory 在使用bioconductor安裝一些包的時(shí)候，比如我安裝GEOquery時(shí)...
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沒(méi)有遇到這樣的問(wèn)題額
Reditools-RNA-editing
最近在做RNA-editing，縱觀文獻(xiàn)綜述，相關(guān)軟件很多，但是屬reditools獨(dú)領(lǐng)風(fēng)騷。不過(guò)還是想吐槽一下這個(gè)軟件，軟件是好軟件，就是文檔寫(xiě)的也太不認(rèn)真了吧。。 今天先...
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Reditools-RNA-editing
最近在做RNA-editing，縱觀文獻(xiàn)綜述，相關(guān)軟件很多，但是屬reditools獨(dú)領(lǐng)風(fēng)騷。不過(guò)還是想吐槽一下這個(gè)軟件，軟件是好軟件，就是文檔寫(xiě)的也太不認(rèn)真了吧。。 今天先...
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Rmarkdown 表格展示問(wèn)題：用Rmarkdown時(shí)，想把大表格用分頁(yè)的方式都展示在Rstudio的html文檔中 解決方案：查了查可以這樣做 79*5的dataframe效果還不錯(cuò)，如下 但是太大...
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第一彈 heatmap熱圖先說(shuō)斷，理不亂 默默關(guān)注生信技能樹(shù)，決心自己也要總結(jié)知識(shí)點(diǎn)分享出來(lái)，菜鳥(niǎo)一只，分享的內(nèi)容有疑問(wèn)請(qǐng)指正！ 函數(shù)：畫(huà)熱圖有眾多函數(shù)，還屬pheatmap好 1test data ...
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個(gè)人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問(wèn))
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寫(xiě)的很棒
白話“卡方檢驗(yàn)”
白話“卡方檢驗(yàn)” 什么是“卡方檢驗(yàn)”？ 卡方檢驗(yàn)是假設(shè)檢驗(yàn)的一種，用于分析兩個(gè)類別變量的相關(guān)關(guān)系，是一種非參數(shù)假設(shè)檢驗(yàn)，得出的結(jié)論無(wú)非就是“兩個(gè)變量相關(guān)”或者“兩個(gè)變量”不相...
個(gè)人介紹
四川大學(xué)研究生在讀，目前主要做single cell ,rna-editing,以及各種生信搬磚。。。菜鳥(niǎo)成長(zhǎng)中