在高通量文章中，經(jīng)常會(huì)出現(xiàn)散點(diǎn)圖這種結(jié)果展示形式，如下圖，用來展示兩組數(shù)據(jù)之間的表達(dá)分布，體現(xiàn)兩組數(shù)據(jù)整體的差異分布情況。X軸和Y軸分別代表兩組的表達(dá)值，藍(lán)色代表兩組無差異的...
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R繪圖|ggplot2散點(diǎn)圖的繪制
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還以為 VSCode 是程序員專屬的工具？那你可太小看它了
如果你知道 VSCode，一說起它，你可能第一個(gè)想到的就是把它當(dāng)做一個(gè)代碼編輯器，而它的界面應(yīng)該可能大概率是這樣的： 如果你恰好又是個(gè)程序員，那你可能經(jīng)常會(huì)用到它，不管是 P...
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高顏值火山圖繪制腳本分析背景 ????火山圖常用于轉(zhuǎn)錄組研究中，也能應(yīng)用于基因組，蛋白質(zhì)組，代謝組等統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)。它歸根到底是是散點(diǎn)圖的一種，它能將統(tǒng)計(jì)學(xué)中的統(tǒng)計(jì)顯著性量度（如p value，矯正后...
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學(xué)習(xí)R語言繪圖，一個(gè)網(wǎng)站就夠了
很多人想學(xué)習(xí)R語言繪圖，最好的辦法就是多進(jìn)行操作，這里有一個(gè)非常好的網(wǎng)站，里面匯集了大量R語言的繪圖代碼，只需將這些代碼復(fù)制下來多去操作就會(huì)有很好的收獲。r-graph-ga...
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使用python處理生物信息數(shù)據(jù)（一）趁疫情被封閉在家，學(xué)習(xí)一下python，之前嘗試過看過perl的書，代碼看得我一臉懵逼，python乍看上去和藹可親多了，再加上有個(gè)師兄鼓勵(lì)和推薦學(xué)習(xí)python，找了這本書...
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ChIP-Seq數(shù)據(jù)挖掘系列-2: Motif 分析(2) - HOMER Motif 分析基本步驟在基因組調(diào)控元件分析中，HOMER 可以用于發(fā)現(xiàn)新的motif。HOMER 通過比較兩個(gè)序列集，再使用ZOOPS scoring (zero or one occurrenc...
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如何將 PROSITE 正則表達(dá)式轉(zhuǎn)換為 Python 正則表達(dá)式(自學(xué)40天)
如何將 PROSITE 正則表達(dá)式轉(zhuǎn)換為Python 正則表達(dá)式 PROSITE(http://prosite.expasy.org/)是蛋白質(zhì)域、蛋白質(zhì)家族和蛋白質(zhì)功能位點(diǎn)...
