安裝配置conda 使用清華源下載sh腳本并安裝 下載完成后直接運(yùn)行腳本文件bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh。需要輸入yes然后等...
這是最近趕的一個 deadline 作品,之前答應(yīng)了 rOpenSci 投一個 technote 小博文。因?yàn)椴荒苤貜?fù)包 Vignette 的內(nèi)容,所以本文我使用了生存分析這...
@周運(yùn)來就是我 嗯,我再看看
scRNA-seq數(shù)據(jù)分析 || Monocle3同系列文章: sc-RAN-seq 數(shù)據(jù)分析||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial[http://www.itdecent.cn/p...
是導(dǎo)入已經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)化并降維的seurat對象還是直接導(dǎo)入cellranger的output文件到monocle,然后再進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化降維處理好呢,這兩個包我已經(jīng)分不清該用哪個做質(zhì)控,降維,可視化了,monocle就多了擬時序分析吧
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為什么要做單細(xì)胞? 可以得到單個細(xì)胞的表達(dá)譜 可以發(fā)現(xiàn)新的細(xì)胞類型或者細(xì)胞狀態(tài)(這里面往往蘊(yùn)含著未知的生物學(xué)狀態(tài)或者過程) 識別細(xì)胞發(fā)育軌跡或者病變細(xì)胞發(fā)生發(fā)展進(jìn)程。 數(shù)據(jù)分...
數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換 data transfer,是將數(shù)據(jù)從一種表示形式變?yōu)榱硪环N表現(xiàn)形式的過程。我們喂給程序的數(shù)據(jù)在任何一個階段都要符合這個程序的數(shù)據(jù)要求,可視化也好,聚類也好,每一種...